R のbio3dのチュートリアルが動かなくて、困っています

前提・実現したいこと

チュートリアルを動かしたいのですが、エラーが出てしまいます。
チュートリアルの項目は、下記の部分です。
PDB structure manipulation and analysis

Coordinate superposition and structural alignment

発生している問題・エラーメッセージ

エラーが出現し、プログラムが動かないです。

該当のソースコード

R
1pdbs <- pdbaln(c("4q21", "521p"), fit=TRUE)

Note: Accessing online PDB files using 4 letter PDBID
Reading PDB files:
https://files.rcsb.org/download/4q21.pdb
https://files.rcsb.org/download/521p.pdb
trying URL 'https://files.rcsb.org/download/4q21.pdb'
downloaded 155 KB

.trying URL 'https://files.rcsb.org/download/521p.pdb'
downloaded 145 KB

.

Extracting sequences
Error in file(file, "r") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(file, "r") : cannot open file 'aln.fa': No such file or directory

試したこと

ダウンロードがうまくできていないと考え、下記のようにダウンロードして、
pdbalnしましたが、同じエラーが出現します。

R
1> files <- get.pdb(c("4q21","5p21"), path=tempdir(), overwrite=TRUE)
2trying URL 'https://files.rcsb.org/download/4q21.pdb'
3downloaded 155 KB
4
5trying URL 'https://files.rcsb.org/download/5p21.pdb'
6downloaded 158 KB
7
8> pdbaln(files)
9Reading PDB files:
10/tmp/RtmpEedN6P/4q21.pdb
11/tmp/RtmpEedN6P/5p21.pdb
12..
13
14Extracting sequences
15Error in file(file, "r") : cannot open the connection
16In addition: Warning message:
17In file(file, "r") : cannot open file 'aln.fa': No such file or directory

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

ここにより詳細な情報を記載してください。

melian

2021/12/09 06:06

参考までに、同じ様な問題が "Seqaln Function Error While Using Bio3D Package In R"(https://www.biostars.org/p/16704/) に載っていて、原因として "you do not have permission to write file aln.fa in your current working directory" とのことです。