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JupyterLab

JupyterLabは、Jupyter notebookの後継の対話型開発環境(IDE)です。データの可視化がインタラクティブで、プラグイン作成により新しいコンポーネントの追加および既存のコンポーネントも統合可能。サーバに閉じているため、データ分析に向いています。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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ImportError: cannot import name 'rescale_affine' from 'nibabel.affines' (/usr/local/lib/python3.7/di

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投稿2021/11/28 00:08

前提・実現したいこと

nibabelのimport nibabel.processing のメソッドを使用した際に上手くダウンロードができませんでした。
また、こちらを使用した際にも機能しなかったです。
機能させるようにするにはどうすればよろしいでしょうか?

発生している問題・エラーメッセージ

ImportError Traceback (most recent call last) <ipython-input-37-a4b1d9ad3a5b> in <module>() 1 ----> 2 import nibabel.processing /usr/local/lib/python3.7/dist-packages/nibabel/processing.py in <module>() 22 spnd, _, _ = optional_package('scipy.ndimage') 23 ---> 24 from .affines import AffineError, to_matvec, from_matvec, append_diag, rescale_affine 25 from .spaces import vox2out_vox 26 from .nifti1 import Nifti1Image ImportError: cannot import name 'rescale_affine' from 'nibabel.affines' (/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/nibabel/affines.py)

該当のソースコード

import nibabel.processing

機能

voxel_size = (2, 2, 2) brain_mri_resized = nibabel.processing.conform(brain_mri, (128, 128, 100), voxel_size, orientation="PSR") brain_mri_resized_data = brain_mri_resized.get_fdata() --------------------------------------------------------------------------- AttributeError Traceback (most recent call last) <ipython-input-38-6c03d113115f> in <module>() 1 voxel_size = (2, 2, 2) ----> 2 brain_mri_resized = nibabel.processing.conform(brain_mri, (128, 128, 100), voxel_size, orientation="PSR") 3 brain_mri_resized_data = brain_mri_resized.get_fdata() AttributeError: module 'nibabel' has no attribute 'processing'

試したこと

調べてもでてこなかったです。
upgradeして、3.0.2に変更したのですが、うまくいきませんでした。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

ここにより詳細な情報を記載してください。

Python3 (3.7.4)
Jupyter Lab version 1.1.4
macbookpro 16

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jbpb0

2021/11/28 03:07

> cannot import name 'rescale_affine' from 'nibabel.affines' (/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/nibabel/affines.py) https://github.com/nipy/nibabel/blob/master/nibabel/affines.py を見ると、328行目に「def rescale_affine(…」と定義されてます 「/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/nibabel/affines.py」内で定義されてるかを確認してみてください > upgradeして、3.0.2に変更した 最新のは3.2.1です https://pypi.org/project/nibabel/
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ベストアンサー

私のPCはWindowsですが、問題なくimportできます。

nibabelのバージョンは最新ですか。私のバージョンは以下です。

python

1>>> print(nibabel.__version__) 23.2.1

です。

投稿2021/11/28 03:14

ppaul

総合スコア24670

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