lambdaでpythonファイルを叩いてもxmlファイルが書き出されない

Lambsaで下記のpythonコードを記述してXMLを書き出したいのですが
書き出してくれません。1台は実行確認済ですが、２台目以降エラーも出ず
困っています。

lambda内コード

import boto3
ec2 = boto3.client("ec2")
ssm = boto3.client("ssm")

def lambda_handler(event, context):
try:
targets = target_instances("Name", "instance name")
if len(targets) == 0:
print("No Targets")
execute(targets, ["cd ファイルまでのディレクトリ;python pythonファイル"])
except Exception as e:

    raise e

def target_instances(tagname, tagvalue):
resp = ec2.describe_instances(Filters=[{"Name": f"tag:{tagname}", "Values": [tagvalue]}])
instances = []
for resv in resp["Reservations"]:
for i in resv["Instances"]:
instances.append(i)
return [instances[0]] # 先頭の1件を選ぶ

def execute(targets, commands):
ids = [i["InstanceId"] for i in targets]
ssm.send_command(
InstanceIds=ids,
DocumentName="AWS-RunShellScript",
Parameters={"commands": commands, "executionTimeout": ["3600"]},
)

上記コードをcron実行していますが、内容の違うpythonファイルを叩いているlambda関数は
正常に実行されているのですが、ディレクトリと叩くpythonファイルの違うlambdaは実行された形跡（xmlファイル書き出し）はありません。lambdaのログも正常でエラーを吐いていません。
cd ファイルまでのディレクトリ;python pythonファイルをpyファイルのディレクトリで
直接実行すればxmlは書き出されます。
何が原因かわかれば非常に助かります。ご助言をいただければ幸いです。
よろしくお願いします。必要な情報があれば言っていただければできる限りアップします。