Pystanのモデルを実行しているのですが、1日たっても終わらず困っております。
直近でPythonの環境構築に使用しているDocker環境を構築し直したことが要因と考えているのですが、
どなたか解決法をご存じの方がいらっしゃいましたらご教示いただけると大変ありがたく存じます。
from pystan import StanModel model = StanModel(model_code="parameters {real y;} model {y ~ normal(0,1);}") print(model.sampling().extract()["y"].mean())
以下の表示のまま、コンパイルが終わらず結果が表示されません。
![
Dockerの環境構築には以下のファイルを使用しております。
<DockerFlie>
FROM continuumio/miniconda3:4.7.12
RUN apt update -y --allow-releaseinfo-change
RUN apt install -y build-essential graphviz fonts-ipafont
COPY conda.txt /tmp/conda.txt
RUN conda install -y --file /tmp/conda.txt
RUN conda install -y -c conda-forge fbprophet==0.6
COPY pip.txt /tmp/pip.txt
RUN pip install -r /tmp/pip.txt
RUN sed -i s/^#font.family:.*sans-serif/font.family\ :\ IPAPGothic/ /opt/conda/lib/python3.7/site-packages/matplotlib/mpl-data/matplotlibrc
EXPOSE 8888 8501 8050 8502 8503
WORKDIR /work
<pip.txt>
setuptools-git==1.2
cmdstanpy==0.4
japanize-matplotlib==1.1.3
pycaret==2.3.3
interpret==0.2.2
sweetviz==2.0.2
openpyxl==3.0.5
optuna==2.3.0
python-pptx==0.6.18
explainerdashboard==0.3.1
sktime==0.4.3
tsfresh==0.17.0
xgboost==1.3.3
catboost==0.24.4
geopy==2.1.0
beautifulsoup4==4.9.3
streamlit== 0.84.2
streamlit-pandas-profiling==0.1.1
ginza==4.0.5
gensim==3.8.3
kneed==0.7.0
pystan==2.17.1.0
scikit-fuzzy==0.4.2
<conda.txt>
scikit-learn==0.23.2
jupyterlab
jupyter
nodejs==6.11.2
requests==2.25.0
tqdm==4.54.0
pip==20.3
pandas==1.2.3
numpy==1.19.2
scipy==1.5.2
matplotlib==3.3.2
seaborn==0.11.0
xlrd==1.2.0
statsmodels==0.12.1
pydotplus==2.0.2
Pythonは3.7、下記の通りCython、pystanのライブラリは無事にインストール済みです。
Package Version
Cython 0.29.21
pystan 2.17.1.0
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