Q&A
Pythonを使って以下のファイルのような形で出力される実験データを３次元の配列にしたいのですが、やり方がわからず困っています。どうか助言をお願いいたします。
Frame=110 nBodies=1 Body 1: Scapula Template 06-14-10 { nMarkers=8 { 1 615.383972 171.701981 1034.619141 2 787.526550 232.100037 1066.639282 3 782.100281 309.912933 912.016968 4 766.111633 129.543274 987.395630 5 754.283447 124.240204 776.277710 6 529.931396 221.584106 766.461121 7 601.411255 248.271500 728.496460 8 483.901428 157.077240 572.009705 } nSegments=0 { } nDofs=0 { } Encoder Zoom=0 Encoder Focus=0 nEvents=0 { } } nUnidentifiedMarkers=0 { } nAnalogChannels=0 nAnalogSamples=0 { } nForceSamples=0 nForcePlates=0 { } nAngleEncoders=0 nAngleEncoderSamples=0 { } Recording=0 Record First Frame=0 Record Last Frame=0 Record File Name= Frame=110 nBodies=1 Body 1: Scapula Template 06-14-10 { nMarkers=8 { 1 615.383972 171.701981 1034.619141 2 787.526550 232.100037 1066.639282 3 782.100281 309.912933 912.016968 4 766.111633 129.543274 987.395630 5 754.283447 124.240204 776.277710 6 529.931396 221.584106 766.461121 7 601.411255 248.271500 728.496460 8 483.901428 157.077240 572.009705 } nSegments=0 { } nDofs=0 { } Encoder Zoom=0 Encoder Focus=0 nEvents=0 { } } nUnidentifiedMarkers=0 { } nAnalogChannels=0 nAnalogSamples=0 { } nForceSamples=0 nForcePlates=0 { } nAngleEncoders=0 nAngleEncoderSamples=0 { } Recording=0 Record First Frame=0 Record Last Frame=0 Record File Name= Frame=110 nBodies=1 Body 1: Scapula Template 06-14-10 { nMarkers=8 { 1 615.383972 171.701981 1034.619141 2 787.526550 232.100037 1066.639282 3 782.100281 309.912933 912.016968 4 766.111633 129.543274 987.395630 5 754.283447 124.240204 776.277710 6 529.931396 221.584106 766.461121 7 601.411255 248.271500 728.496460 8 483.901428 157.077240 572.009705 } nSegments=0 { } nDofs=0 { } Encoder Zoom=0 Encoder Focus=0 nEvents=0 { } } nUnidentifiedMarkers=0 { } nAnalogChannels=0 nAnalogSamples=0 { } nForceSamples=0 nForcePlates=0 { } nAngleEncoders=0 nAngleEncoderSamples=0 { } Recording=0 Record First Frame=0 Record Last Frame=0 Record File Name= Frame=110 nBodies=1 Body 1: Scapula Template 06-14-10 { nMarkers=8 { 1 615.383972 171.701981 1034.619141 2 787.526550 232.100037 1066.639282 3 782.100281 309.912933 912.016968 4 766.111633 129.543274 987.395630 5 754.283447 124.240204 776.277710 6 529.931396 221.584106 766.461121 7 601.411255 248.271500 728.496460 8 483.901428 157.077240 572.009705 } nSegments=0 { } nDofs=0 { } Encoder Zoom=0 Encoder Focus=0 nEvents=0 { } } nUnidentifiedMarkers=0 { } nAnalogChannels=0 nAnalogSamples=0 { } nForceSamples=0 nForcePlates=0 { } nAngleEncoders=0 nAngleEncoderSamples=0 { } Recording=0 Record First Frame=0 Record Last Frame=0 Record File Name= Frame=111 nBodies=1 Body 1: Scapula Template 06-14-10 { nMarkers=8 { 1 616.157776 172.027985 1035.365234 2 787.777283 232.667007 1066.602417 3 782.029297 309.983612 911.931396 4 766.437561 129.747406 987.528137 5 754.172974 124.271301 776.421021 6 524.770874 216.914749 768.578979 7 594.430054 246.035797 729.123291 8 478.217957 148.297943 575.731018 } nSegments=0 { } nDofs=0 { } Encoder Zoom=0 Encoder Focus=0 nEvents=0 { } } nUnidentifiedMarkers=0 { } nAnalogChannels=0 nAnalogSamples=0 { } nForceSamples=0 nForcePlates=0 { } nAngleEncoders=0 nAngleEncoderSamples=0 { } Recording=0 Record First Frame=0 Record Last Frame=0 Record File Name=
ここで、nMarker=8の下に書かれている数値が取り出したい数値です。
1~8までそれぞれのマーカのXYZ軸のデータが並んでいます。計測するごとにその瞬間のデータが出力されるため、今回は５回の計測により５回出力されています。
これを軸ごとに次元に分けて、かつ同じマーカの同じ軸の値は同じ行とした配列を作りたいと思っています。
例としては以下のように考えています。
[[[615.383972 615.383972 ...]
[787.526550 787.526550 ...]
[782.100281 782.100281 ...]
[766.111633 ... ]
[754.283447 ... ]
[529.931396 ... ]
[601.411255 ... ]
[483.901428 ... ] ]
[[171.701981 ... ]
[232.100037 ... ]
[309.912933 ... ]
[129.543274 ... ]
[124.240204 ... ]
[221.584106 ... ]
[248.271500 ... ]
[157.077240 ... ] ]
[[1034.619141 ... ]
[1034.619141 ... ]
[1066.639282 ... ]
[912.016968 ... ]
[987.395630 ... ]
[776.277710 ... ]
[766.461121 ... ]
[728.496460 ... ]
[572.009705 ... ] ]]
このようなプログラムの書き方をどなたか教えていただけませんか。使えるモジュールだけでも構いません。よろしくお願いします。
また、すこし話が変わってしまいますが、実際の計測ではこれらのデータを出力するtxtファイルはリアルタイムで更新されるので、pythonで読み込んだ時の総行数は毎回変わってしまいます。これを毎回読み込んだ瞬間の最終行まで配列化できるような処理があればさらに良いと思っています。もしよろしければこちらにも助言をいただけると幸いです。
回答1件
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ベストアンサー
こういうコードは作るのは簡単なのですが作り方を説明するのは非常に難しいです。
説明するのが大変なので、コードだけ載せておきます。
python
1import numpy as np 2 3def make_1D(data_1D): 4 return [float(s) for s in data_1D.split()][1:] 5 6def make_2D(data_2D): 7 return [make_1D(s) for s in data_2D] 8 9with open('data3D.txt') as f: 10 data = f.readlines() 11 12list_3D = [] 13for i in range(len(data)): 14 if data[i] == ' nMarkers=8\n': 15 list_3D.append(np.array(make_2D(data[i+2:i+10]))) 16 17result = np.stack(list_3D).T 18print(result)
実行結果
python
1>>> import numpy as np 2>>> 3>>> def make_1D(data_1D): 4... return [float(s) for s in data_1D.split()][1:] 5... 6>>> def make_2D(data_2D): 7... return [make_1D(s) for s in data_2D] 8... 9>>> with open('data3D.txt') as f: 10... data = f.readlines() 11... 12>>> list_3D = [] 13>>> for i in range(len(data)): 14... if data[i] == ' nMarkers=8\n': 15... list_3D.append(np.array(make_2D(data[i+2:i+10]))) 16... 17>>> result = np.stack(list_3D).T 18>>> print(result) 19[[[ 615.383972 615.383972 615.383972 615.383972 616.157776] 20 [ 787.52655 787.52655 787.52655 787.52655 787.777283] 21 [ 782.100281 782.100281 782.100281 782.100281 782.029297] 22 [ 766.111633 766.111633 766.111633 766.111633 766.437561] 23 [ 754.283447 754.283447 754.283447 754.283447 754.172974] 24 [ 529.931396 529.931396 529.931396 529.931396 524.770874] 25 [ 601.411255 601.411255 601.411255 601.411255 594.430054] 26 [ 483.901428 483.901428 483.901428 483.901428 478.217957]] 27 28 [[ 171.701981 171.701981 171.701981 171.701981 172.027985] 29 [ 232.100037 232.100037 232.100037 232.100037 232.667007] 30 [ 309.912933 309.912933 309.912933 309.912933 309.983612] 31 [ 129.543274 129.543274 129.543274 129.543274 129.747406] 32 [ 124.240204 124.240204 124.240204 124.240204 124.271301] 33 [ 221.584106 221.584106 221.584106 221.584106 216.914749] 34 [ 248.2715 248.2715 248.2715 248.2715 246.035797] 35 [ 157.07724 157.07724 157.07724 157.07724 148.297943]] 36 37 [[1034.619141 1034.619141 1034.619141 1034.619141 1035.365234] 38 [1066.639282 1066.639282 1066.639282 1066.639282 1066.602417] 39 [ 912.016968 912.016968 912.016968 912.016968 911.931396] 40 [ 987.39563 987.39563 987.39563 987.39563 987.528137] 41 [ 776.27771 776.27771 776.27771 776.27771 776.421021] 42 [ 766.461121 766.461121 766.461121 766.461121 768.578979] 43 [ 728.49646 728.49646 728.49646 728.49646 729.123291] 44 [ 572.009705 572.009705 572.009705 572.009705 575.731018]]]
投稿2021/09/14 07:30
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2021/09/15 03:59