pdbのファイルが開けない

Question

python でプログラムを作成しています。
rmsdの計算をするのにpipでダウンロードし、
calculate_rmsd proteina.pdb proteinb.pdbと打ち込んで計算を行いましたが、

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'protein.a.pdb'
というエラーが発生しています。
ファイルは存在しているのですがなぜ開けないのかがわからず困っております。

Comments

[jbpb0]

> calculate_rmsd proteina.pdb proteinb.pdbと打ち込んで計算を行いました

では「proteina.pdb」ですが、

> FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'protein.a.pdb'
というエラーが発生

では「protein.a.pdb」と、ファイル名が違います

本当に存在してるファイル名はどちらなのでしょうか？

また、コマンドを実行した時に実際に指定したのはどちらだったのでしょうか？

Answer 1

そのファイルが存在している場所を指定できていないから、見つからないというエラーが出ます
まずはフルパスで指定してみては

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'protein.a.pdb'

って、ファイル名の指定、あってますか？