fastaファイルを生成できていない問題

Question

下記のコードでfastaファイルの生成を試みたのですが、ファイルが生成されないのですが。
３つのfastaフィルを作成しようとしています。
何か間違ってる箇所ありますか？
実行コマンドでは、何も特にエラーもでないし、コメントもでません。
また、もしfastaファイルが新しく生成されたなら、どこにそのファイルが出現するのでしょうか？

よろしくお願いいたします。

補足：初心者で、どこに生成するとか指定がわかりません。
インデントは、入力段階で入力してますが、質問欄で反映されてると良いのですが。

python

S = SeqIO.read("vv.fasta", "fasta")
S_S = S[20000:22000]
 
def yield_S_t():
　for var in S_S:
    var.seq = S_S.seq.translate()
    var.id = S_S.id
    var.description = S_S.description 
    yield var
 
    S_t = yield_S_t()
    S_tt = S_t[10:1000]
 
 
def generation():
  with open('bb.fasta') as file:
    for list_record in list(SeqIO.parse(file, "fasta")):
      list_record.seq = list_record.seq[20000:22000]
 
      list_record.seq.translate()
      list_record.id = list_record.id
 
      yield list_record
 
      g_t = generation()
      g_tt = g_t[10:1000]
 
    seq1 = S_tt
    seq2 = g_tt
        
    All_Seq = [seq1, seq2]
 
  SeqIO.write(seq1,"EE.fasta", "fasta")
  SeqIO.write(seq2, "FF.fasta", "fasta")
 
  SeqIO.write(All_Seq,"GG.fasta","fasta")
 
 
  EE.fasta.close()
  FF.fasta.close()
  GG.fasta.close()

```
コード




S = SeqIO.read("vv.fasta", "fasta")
S_S = S[20000:22000]
 
def yield_S_t():
　for var in S_S:
    var.seq = S_S.seq.translate()
    var.id = S_S.id
    var.description = S_S.description 
    yield var
 
    S_t = yield_S_t()
    S_tt = S_t[10:1000]
 
 
def generation():
  with open('bb.fasta') as file:
    for list_record in list(SeqIO.parse(file, "fasta")):
      list_record.seq = list_record.seq[20000:22000]
 
      list_record.seq.translate()
      list_record.id = list_record.id
 
      yield list_record
 
      g_t = generation()
      g_tt = g_t[10:1000]
 
    seq1 = S_tt
    seq2 = g_tt
        
    All_Seq = [seq1, seq2]
 
  SeqIO.write(seq1,"EE.fasta", "fasta")
  SeqIO.write(seq2, "FF.fasta", "fasta")
 
  SeqIO.write(All_Seq,"GG.fasta","fasta")
 
 
  EE.fasta.close()
  FF.fasta.close()
  GG.fasta.close()

Comments

[1T2R3M4]

言語は何なのでしょうか。
pythonでしたらインデントを正しく表現してください。

>もしfastaファイルが新しく生成されたなら、どこにそのファイルが出現する
どこにできるようにsaddanandaさんはプログラミングしたのですか。

[saddananda]

すいません、インデントを入れてるのですが、表記されません。もう一度やってみますので、よろしくお願いいたします。どこに出現するかの設定をしているかもわからないのですが、確認方法を教えて頂けると幸いです。

[KojiDoi]

＞インデント
後ろの方の「インデントできてない」ほうのコードは消しておきましょう。

Answer 1

ざっと見た限り、ファイルへの出力以前にAll_Seq, seq1, seq2などが意図通りに作成されていないのでは？

Answer 2

コードの１番最後に以下を追加してください。

import os
print(os.getcwd())

これで表示されるディレクトリの下を探すと見つかる可能性大です。

Comments

[saddananda]

やってみましたが、生成したいものが現れないので、生成されていないみていです。
上記コードどこをなおすべきでしょうか？インデントも含めて。