fastaのファイル作成でのエラー（'str' object has no attribute 'id'

Question

A = SeqIO.read("EPI.fasta", "fasta")
A_S = A[20000:22000]
A_SS = A_S.translate()

SeqIO.write(seq1,"new.fasta","fasta")

と書きましたが、'str' object has no attribute 'id'と出力されます。
IDも残したいし、修正を加えたsequenceをもちろんデータを入れたいのです。（修正前sequenceは要らないですが）。

どうやったら、ID,と新しいsequenceデータを含んだ、新しいfastaファイルを生成できますか？

Comments

[KojiDoi]

質問を出すときは、見た人が現象を再現できる最低限のコードとサンプルデータを提示してください。これでは見た人は可能性を想像することしかできません。
プログラムコードは
https://teratail.com/help/question-tips#questionTips3-5-1
をみて、正しく「シンタックスハイライト」がかかった状態で提示してください。

[saddananda]

次回は気を付けます。

Answer 1

id, description, sequenceを定義すると解決しました。