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Google Colaboratoryとは、無償のJupyterノートブック環境。教育や研究機関の機械学習の普及のためのGoogleの研究プロジェクトです。PythonやNumpyといった機械学習で要する大方の環境がすでに構築されており、コードの記述・実行、解析の保存・共有などが可能です。

Kaggle

Kaggleは、機械学習モデルを構築するコンペティションのプラットフォームおよびその運営企業を指します。企業や政府といった組織とデータサイエンティスト・機械学習エンジニアを繋げるプラットフォームであり、単純なマッチングではなくコンペティションが特徴です。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

zip

ZIPとは、複数のファイルをひとつにまとめて圧縮したり、圧縮したファイルを展開することができるアーカイブフォーマットです。 1998年以降のWindowsOS各バージョンで、標準の圧縮フォルダとして採用されています。 MacOSでも、X v10.3以降に他の圧縮ソフトとまとめてZIP機能を採用しています。

Google

Googleは、アメリカ合衆国に位置する、インターネット関連のサービスや製品を提供している企業です。検索エンジンからアプリケーションの提供まで、多岐にわたるサービスを提供しています。

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google drive内における大容量.zipファイルの解凍をしたい(kaggle)

ssk1

総合スコア8

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zip

ZIPとは、複数のファイルをひとつにまとめて圧縮したり、圧縮したファイルを展開することができるアーカイブフォーマットです。 1998年以降のWindowsOS各バージョンで、標準の圧縮フォルダとして採用されています。 MacOSでも、X v10.3以降に他の圧縮ソフトとまとめてZIP機能を採用しています。

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投稿2021/04/20 09:54

前提・実現したいこと

8GBの.zipファイルをgoogle drive内で解凍し、そのデータをgoogle colab(pro)で読み込んで、pythonによるGPUを使ったディープラーニングの学習をしたいと考えています。

発生している問題・エラーメッセージ

現在データサイエンスコンペであるkaggleに参加していますが、参加しているコンペのデータ・モデルの特徴上、GPUを使った学習でも1エポック5時間以上かかるようなので、google colab proの登録及び、google driveの容量を100GBに拡張しました。
kaggleからAPIを用いてgoogle drive内に.zipファイルをダウンロードをするところまではうまくいったのですが、以下の3つの手法を試しても解凍がうまくいきません。
※なお自分のPCでは正常に解凍が完了することは確認しました。

試したこと

①google colabにおいて、!unzip ZIPファイルPATH -d 解凍先PATH(google drive内)を実行
→google drive内のファイルが多すぎるとのエラー(容量には80GB以上の余裕あり)

②zip extractorを使用
→何度やっても完了直前にgoogle chromeの応答がなくなる(これはintel xeon, メモリ32GBのパソコンで試してみても同様でした)

③自分のPCで解凍してからgoogle driveにコピー
→3日たった現在でも完了しない

補足

.zipファイルには、400万枚の画像と.csvが3ファイル入っています。

.zipファイルのままでも学習を行えるなど、代案があればそれでも構いません。
ご教示いただけると幸いです。

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ベストアンサー

ベストな方法かどうかわかりませんが、zipファイルを展開せずに、中身を読み込む方法です。
zipfileモジュールを使います。
https://docs.python.org/ja/3/library/zipfile.html

具体的にどういう処理をしたいかわからないので、参考までにこんな感じです。

python

1import zipfile 2import pandas as pd 3from PIL import Image 4 5with zipfile.ZipFile('data.zip', 'r') as zf: 6 with zf.open('foo/bar.csv', 'r') as f: 7 df = pd.read_csv(f) 8 9data = [] 10with zipfile.ZipFile('data.zip', 'r') as zf: 11 for name in zf.namelist(): 12 if 'foo' in name and name.endswith('.jpg'): 13 with zf.open(name, 'r') as f: 14 data.append(Image.open(f))

上は foo/bar.csv という名前でzipに入っているファイルをpandasで読み込んでいます。

下は foo/*.jpg とか */*foo*.jpg みたいな、名前にfooを含んで.jpgで終わるファイルをPILで読み込んでリストに入れていく処理です。

投稿2021/04/23 06:16

bsdfan

総合スコア4794

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ssk1

2021/04/23 09:48

なるほど、ありがとうございます。 他に解決策がなさそうでしたら、zipfileモジュールを試してみたいと思います。
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