あなたが管理するサーバでホストしているスクリプトを読み込むように推奨しているのであれば、そのコードを変えることについて、十分なアナウンスと互換性の検証があれば、やってもよいとは思います。
たとえば、はてなブックマークボタンは過去に変更をしています。
はてなブックマークボタンが2017年2月から新しくなります - はてなブックマーク開発ブログ
ただし、以下の理由により、あまり良いことではないかも、と思います。
最近はintegrity
属性を利用することが増えています。
サブリソース完全性は、ウェブアプリケーションやウェブ文書が (CDN など任意の場所から) 取得したファイルについて、第三者によってファイルの中に別のものが挿入されていないか、そして、それらのファイルに対してその他の改ざんが行われていないかを検証することにより、先程のような攻撃のリスクを軽減します。
サブリソース完全性 - Web セキュリティ | MDN
何の通知もしない場合、または通知を見逃した利用者がいた場合、integrity
属性を利用していると全く動作しなくなります。
また、integrity
属性を使用していなくても、ある日突然配信されているコードが変わっていたら**「もしかして乗っ取られた?」という不安**を利用者に与えることになるでしょう。
以下は蛇足ですが。
jQuery の CDN に、以前はlatest
があったのはご存知ですか?
CDN へのリクエスト統計を見ると、jquery-latest.js が最もリクエストされているファイルだと言うことがわかるし、jquery-latest.js / jquery-latest.min.js の両ファイルは、手軽に最新版の jQuery を取得できるから便利なのはわかるけど、本番環境でこれを使っている開発者は、jQuery のバージョンアップの度に Web サイトが動作しなくなる危険をユーザーに与えてるんだよってこと
jQuery 公式 Blog 「jquery-latest.js を使用するのをやめろ」 | WWW WATCH
ちなみに、このjquery-latest.jsは今も動いています。互換性のため動かさざるを得ない、ということですね。
https://code.jquery.com/jquery-latest.js