python pyenvでのpandasのinstallおよびimportの解消 export LDFLAGS

Question

前提・実現したいこと

python 3.8.6
Mac Big Sur

pyenvでpython 3.8.6をインストールする際に、
zlibのエラーが出るため、
% brew install zlib
% export LDFLAGS="-L/usr/local/opt/zlib/lib"
% export CPPFLAGS="-I/usr/local/opt/zlib/include"
をしたら、インストールが可能となった。

しかし、次にpandasをimportする際に、
ImportError: No module named '_bz2'
のエラーが発生する。

これを解消する方法が、
export LDFLAGS="-L/usr/local/opt/bzip2/lib"
export CPPFLAGS="-I/usr/local/opt/bzip2/include"

として、pyenvからpythonを再インストールすることらしいが、

zlibと、bzip2において、
両方の
export LDFLAGS、 export CPPFLAGS
を同時にする方法はないのでしょうか。

よろしくお願いいたします。

Comments

[quickquip]

CPUはApple Siliconじゃないですよね? 念のため。

[quickquip]

あと Command Line Tools はなにをインストールしてますか?

[pokeharry]

ありがとうございます。

Apple Siliconではありません。
コマンドラインツールは、xcode12.3です！

[pokeharry]

回答ありがとうございます。
追記の分について試してみたのですが、未だに
WARNING: The Python bz2 extension was not compiled. Missing the bzip2 lib?
が生じてしまいます。

Answer 1

-L -Iオプションを複数並べます。

% export LDFLAGS="-L/usr/local/opt/zlib/lib -L/usr/local/opt/bzip2/lib" 
% export CPPFLAGS="-I/usr/local/opt/zlib/include -I/usr/local/opt/bzip2/include" 

こうですね。

---

Homebrew で zlib readline bzip2 をインストールした上で

CPPFLAGS="-I$(brew --prefix openssl)/include -I$(brew --prefix bzip2)/include -I$(brew --prefix readline)/include -I$(brew --prefix zlib)/include" LDFLAGS="-L$(brew --prefix openssl)/lib -L$(brew --prefix readline)/lib -L$(brew --prefix zlib)/lib -L$(brew --prefix bzip2)/lib" pyenv install 3.8.6

でどうですか? （特に export する必然はないかと思いますが）

---

ls -l /usr/local/opt/bzip2

すると
本来なら /usr/local/opt/bzip2 -> ../Cellar/bzip2/1.0.8/ と表示されて、 /usr/local/Cellar/bzip2/1.0.8/ のシンボリックリンクであることが確認できるはずですが、そうなってないとか、brew 由来じゃない bzip2 がそこにあるとかではないでしょうか。

brew uninstall --force --ignore-dependencies bzip2
brew cleanup -s bzip2
brew cleanup --prune-prefix
rm -Rf /usr/local/Cellar/bzip2 /usr/local/opt/bzip2
brew install bzip2

とかでしょうか。

Comments

[pokeharry]

ありがとうございます。

~/.zshrcファイルに書いて
やってみたのですが、未だに以下の警告が病みません。
WARNING: The Python bz2 extension was not compiled. Missing the bzip2 lib?

もし、他に解決案があれば教えていただきたいです。

[quickquip]

私の環境の Command Line Tools は 12.2 です。（一応）

[quickquip]

（pyenvをHomebrewでインストールしたなら依存関係で入ったはずなのですが一応）

brew --prefix bzip2
を実行すると
/usr/local/opt/bzip2
が表示されますか?

ls /usr/local/opt/bzip2/{lib,include}
すると bzlib.h と libbz2.a がありますか?

[pokeharry]

ls /usr/local/opt/bzip2/{lib,include}

とすると
ls: /usr/local/opt/bzip2/include: No such file or directory
/usr/local/opt/bzip2/lib:
と帰ってきました。

brew --prefix bzip2
を実行すると
/usr/local/opt/bzip2
でした。

[quickquip]

ヘッダファイルがないようです。
brew reinstall bzip2
してみてファイルが置かれないでしょうか?

[pokeharry]

brew reinstall bzip2
と
Warning: You are using macOS 11.0.
We do not provide support for this released but not yet supported version.
You will encounter build failures with some formulae.
Please create pull requests instead of asking for help on Homebrew's GitHub,
Twitter or any other official channels. You are responsible for resolving
any issues you experience while you are running this
released but not yet supported version.

Error: /usr/local/opt/bzip2 is not a valid keg

となりました。
macOS11の場合でもインストールできる方法はあるのでしょうか？

[pokeharry]

ありがとうございます。
追記の分についてやってみたらできました！