gulpとwebpackを使用した際の、複数のエントリーポイントがありフォルダ構成を維持したい場合

Question

gulpでwebpackを使いコンパイルしています。
その際、複数のエントリーポイントがあるのですが、エントリーポイントの位置（フォルダ構成）を維持して吐き出したいのですがdist直下に吐き出されてしまいます。

理想は下記です。

src/assets/dist/js/works/design/index.js
src/js/app.js

↓

dist/assets/dist/js/works/design/index.js
dist/js/app.js

gulp.task('js', () => {
    return gulp.src(config.path.src.js, { base: './src/'}) // 中身は 'src/**/*.js',
        .pipe(webpackStream(webpackConfig, webpack))
        .pipe(gulp.dest(config.path.dist)) // 中身は'dist';
        .pipe(browserSync.stream());
});

　　・・・その他のコード
    entry: {
        app: './src/js/app.js',
        index: './src/assets/dist/js/works/design/index.js'
    },
	output: {
		filename: '[name].js'
	},
   ・・・その他のコード

なかなかうまくいかず、、お知恵をお借りすることは出来ますでしょうか？

Answer 1

自己解決しました！
下記ブログがすごい参考になりましたし、npmの公式のwebpack-streamページにもヒントがありました。
http://2no.hatenablog.com/entry/2015/06/08/170511

gulp.task('js', () => {
    return gulp.src(config.path.src.js, { base: './src/' }) // config.path.src.jsはエントリーポイントのみ
        .pipe(named(function(file) {
            return file.relative.replace(/.[^.]+$/, '');
        }))
        .pipe(webpackStream(webpackConfig, webpack))
        .pipe(gulp.dest(config.path.dist))
        .pipe(browserSync.stream());
});

        ...その他のコード
	output: {
		filename: '[name].js'
	},
        ...その他のコード
        // エントリーポイントは書かない！！！