Jenkinsで作成したexeファイルが動かない

Jenkinsでexeファイルを作成したのですが起動しませんでした。
原因として、matplotlibがimportされていないそうで、ModuleNotFoundError:NO module named'matplotlib'と、exeファイルを開いた際に表示されます。
しかし開発環境のVSCodeでは実行できていて、pip install matplotlibもしています。

どなたかご教授お願い致します。

追記
簡単にコードを記載します

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

x = np.array(['ERS1', 'ERS2', 'ETR1', 'ETR2', 'EIN4'])
y = np.array([12.0, 3.1, 11.8, 2.9, 6.2])

x_position = np.arange(len(x))

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(1, 1, 1)
ax.bar(x_position, y, tick_label=x)
ax.set_xlabel('gene')
ax.set_ylabel('gene expression [log(TPM)]')
plt.title("test")
fig.autofmt_xdate(rotation=45)
fig.show()

コマンドプロンプトからpyinstaller ***.py --onefileで作成しようとしましたがこちらもダメでした。
exe化してからのエラーとして、
MatplotlibDeprecationWarning: Matplotlib installs where the data is not in the mpl-data subdirectory of the package are deprecated since 3.2 and support for them will be removed two minor releases later.
とでてきました。
結局のところVScode上ではmatplotlibは反応しているけどexe化すると反応しなくなる？状態になります。

追記２
matplotlibのバージョンを落としたら、pyinstallerでexe化はできました。
ただJenkinsではできない状況が続いています。