python データの読み込みがうまくいきません。

Question

前提・実現したいこと

データの分布を、ガウス混合モデルを使用して可視化したいのですが、
def gen_data()内のreturnするところで
Instance of 'tuple' has no 'data' member
Instance of 'tuple' has no 'target' member
というエラーが出てしまいます。
エラー解消方法をいろいろと調べてみたのですが、解決に至りませんでした。

解決方があれば教えて頂きたいです。よろしくお願いします。

発生している問題・エラーメッセージ

Instance of 'tuple' has no 'data' member
Instance of 'tuple' has no 'target' member

該当のソースコード

import numpy as np
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.cluster import KMeans as KM
from sklearn.mixture import GaussianMixture as GMM
from matplotlib import pyplot as plt
from skfuzzy.cluster import cmeans

def target_to_color(target):
    if type(target) == np.ndarray:
        return (target[0], target[1], target[2])
    else:
        return "rgb"[target]

def plot_data(data, target, filename="fig.png"):
    plt.figure()
    plt.scatter(data[:,0], data[:,1], c=[target_to_color(t) for t in target])
    plt.savefig(filename)

def gen_data():
    iris = load_iris()
    pca = PCA(n_components=2)
    return pca.fit_transform(iris.data), iris.target

def main():
    data, target = gen_data()
    plot_data(data, target, filename="origin.png")

    gmm = GMM(n_components=3, max_iter=1000)
    gmm.fit(data)
    gmm_target = gmm.predict(data)
    gmm_target_proba = gmm.predict_proba(data)
    plot_data(data, gmm_target, filename="gmm.png")
    plot_data(data, gmm_target_proba, filename="gmm_proba.png")

if __name__ == "__main__":
    main()

補足情報

Python 3.8.5

Comments

[meg_]

> モジュールやpythonは最新バージョンに更新してあります。
バージョンを明記してください。　※質問に追記してください。

エラーメッセージは全文掲載してください。（ユーザー名等は隠してもらって構いません）

[pd0rnb]

失礼しました。追伸いたしました。
エラーはこちらの二行のみになります。
実行すると、ターミナル上にエラーメッセージは出てこないのですが、ソースコードの該当箇所に下線と問題点（エラー内容）がでてきます。

Answer 1

質問のコードを実行しましたがエラーは再現しませんでした。

Python 3.8.3、scikit-learn 0.23.1

実行したコードは下記です。

import numpy as np
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.cluster import KMeans as KM
from sklearn.mixture import GaussianMixture as GMM
from matplotlib import pyplot as plt
#from skfuzzy.cluster import cmeans

def target_to_color(target):
    if type(target) == np.ndarray:
        return (target[0], target[1], target[2])
    else:
        return "rgb"[target]

def plot_data(data, target, filename="fig.png"):
    plt.figure()
    plt.scatter(data[:,0], data[:,1], c=[target_to_color(t) for t in target])
    plt.savefig(filename)

def gen_data():
    iris = load_iris()
    pca = PCA(n_components=2)
    return pca.fit_transform(iris.data), iris.target

def main():
    data, target = gen_data()
    plot_data(data, target, filename="origin.png")

    gmm = GMM(n_components=3, max_iter=1000)
    gmm.fit(data)
    gmm_target = gmm.predict(data)
    gmm_target_proba = gmm.predict_proba(data)
    plot_data(data, gmm_target, filename="gmm.png")
    plot_data(data, gmm_target_proba, filename="gmm_proba.png")

if __name__ == "__main__":
    main()

Comments

[pd0rnb]

ご回答ありがとうございます。
貼り付けて頂いたソースコードでも、同様のエラーが出てしまいます。
環境の問題なのでしょうか…

[meg_]

google colabでも試しましたが問題なくグラフまで表示されました。
コードの問題ではなさそうです。
一度ターミナルやjupyter notebookで試してみてはどうでしょうか？

[meg_]

質問に追加された画像を見ると、irisはBunch型なのにtupleとして認識？されているような感じですね。
こちらは何かしらのIDEの画面でしょうか？その辺りの環境についても質問に書いたりタグ設定すると詳しい方が見てくれるかもしれません。

[pd0rnb]

色々試していただき誠にありがとうございます。
google colabで試してみたところ、無事作動しましたが、jupyterでは作動しませんでした。
jupyterは私自身が使用しているpythonと紐づけれらているので、私のpythonアプリかIDEがおかしいのですかね。
最インストール等検討しようと思います...

[meg_]

jupyter notebookでも問題なく実行出来ました。（Python 3.8.3）