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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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プロモーターのタグから遺伝子ごとにTPM(transcripts per million )をまとめる作業をしています。オブジェクト 'Progress' がありませんというエラーを解除したいです。

s159057

総合スコア8

R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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投稿2020/07/28 07:39

前提・実現したいこと

ここに質問の内容を詳しく書いてください。
プロモーターのタグから遺伝子ごとにTPM(transcripts per million )をまとめる作業をしています。

発生している問題・エラーメッセージ

paste0(" ##### Progress:", Progress, "% #####\r") でエラー:
オブジェクト 'Progress' がありません

エラーメッセージ ```setwd("/Users/shojima/Desktop/R_Practice/data") > expMatrix <- read.table("iPS_HEP_diff_F5.TPM_2.txt", header=TRUE, row.name=NULL, sep="\t", stringsAsFactors=FALSE) > expMatrix <- expMatrix[,c(1,2,3,4,14,15,16,5,6,7,8,9,10,11,12,13)] > promoterID <- expMatrix[,"prmtrID"] > gene_name <- sapply(strsplit(promoterID, "@"), function(x){x[2]}) > unique.gene_name <- unique(gene_name) > gene_expMatrix <- NULL > counter <- 0 > for(i in unique.gene_name){ + gene_expMatrix <- rbind(gene_expMatrix, apply(expMatrix[which(gene_name == i),-1],2,sum)) + counter <- counter + 1 + progress <- floor((counter/length(unique.gene_name))*100) + cat(paste0(" ##### Progress:",Progress, "% #####\r")) + } paste0(" ##### Progress:", Progress, "% #####\r") でエラー: オブジェクト 'Progress' がありません ```ここに言語名を入力 R言語

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回答1

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ベストアンサー

これは単に先頭大文字小文字の違いですね

R

1progress <- floor((counter/length(unique.gene_name))*100)

progress と先頭小文字

R

1cat(paste0(" ##### Progress:",Progress, "% #####\r"))

Progress と先頭大文字

どちらかに合わせればよろしいかと

投稿2020/07/28 08:33

aokikenichi

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