質問をすることでしか得られない、回答やアドバイスがある。

15分調べてもわからないことは、質問しよう!

新規登録して質問してみよう
ただいま回答率
85.35%
grep

grepはコマンドライン上でテキスト検索を可能にするユーティリティーです。元はUnixのために用意されたものです。

sed

sedとは、POSIX環境のために作られたコマンドラインエディタです。sedは編集スクリプトの指示のもとに複数のファイルを編集し、標準出力にその結果を出力します。

Q&A

解決済

1回答

1909閲覧

行内のある特定の文字以降を削除する方法

ykyoko

総合スコア2

grep

grepはコマンドライン上でテキスト検索を可能にするユーティリティーです。元はUnixのために用意されたものです。

sed

sedとは、POSIX環境のために作られたコマンドラインエディタです。sedは編集スクリプトの指示のもとに複数のファイルを編集し、標準出力にその結果を出力します。

0グッド

0クリップ

投稿2020/07/16 08:14

行内のある特定の文字以降を削除する方法

行内のある特定の文字以降を削除する方法(コマンド)を教えて頂けないでしょうか?
(PCはMACです)
ある特定の文字以降を全て削除するコマンドは確認できましたが、特定の文字を含むその行内のみで、それがtextファイル内で複数行ある場合の対処方法がよくわかりません

具体的には、
例えば以下のようなtextファイルの中で、"strain"以降の文字を削除して
結果Bのようにしたいです
"strain"の前にスペースがありますが、このスペースも省けるとなおありがたいです
よろしくお願い致します

[処理前]

123456 aaaaa strain ccccc dhstag

atcgatcgatcgatcgatcgatcg

213456 aychan strain ggggg arcga

atcgatcgatcgatcgatcgatcgat

3425167 ahftga strain hhhhh cghsyt

sgatgstcatsgctsgtag


[結果B]

123456 aaaaa

atcgatcgatcgatcgatcgatcg

213456 aychan

atcgatcgatcgatcgatcgatcgat

3425167 ahftga

sgatgstcatsgctsgtag

発生している問題・エラーメッセージ

エラーメッセージ

該当のソースコード

ソースコード

試したこと

ここに問題に対して試したことを記載してください。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

ここにより詳細な情報を記載してください。

気になる質問をクリップする

クリップした質問は、後からいつでもMYページで確認できます。

またクリップした質問に回答があった際、通知やメールを受け取ることができます。

バッドをするには、ログインかつ

こちらの条件を満たす必要があります。

guest

回答1

0

ベストアンサー

sed 's/ *strain.*$//' < input.fasta > output.fasta

投稿2020/07/16 08:17

KojiDoi

総合スコア13692

バッドをするには、ログインかつ

こちらの条件を満たす必要があります。

ykyoko

2020/07/16 20:57

できました! なるほど、置換後を//にすればよかったのですね ありがとうございました
guest

あなたの回答

tips

太字

斜体

打ち消し線

見出し

引用テキストの挿入

コードの挿入

リンクの挿入

リストの挿入

番号リストの挿入

表の挿入

水平線の挿入

プレビュー

15分調べてもわからないことは
teratailで質問しよう!

ただいまの回答率
85.35%

質問をまとめることで
思考を整理して素早く解決

テンプレート機能で
簡単に質問をまとめる

質問する

関連した質問