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sedとは、POSIX環境のために作られたコマンドラインエディタです。sedは編集スクリプトの指示のもとに複数のファイルを編集し、標準出力にその結果を出力します。

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行内のある特定の文字以降を削除する方法

ykyoko

総合スコア2

grep

grepはコマンドライン上でテキスト検索を可能にするユーティリティーです。元はUnixのために用意されたものです。

sed

sedとは、POSIX環境のために作られたコマンドラインエディタです。sedは編集スクリプトの指示のもとに複数のファイルを編集し、標準出力にその結果を出力します。

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投稿2020/07/16 08:14

行内のある特定の文字以降を削除する方法

行内のある特定の文字以降を削除する方法(コマンド)を教えて頂けないでしょうか?
(PCはMACです)
ある特定の文字以降を全て削除するコマンドは確認できましたが、特定の文字を含むその行内のみで、それがtextファイル内で複数行ある場合の対処方法がよくわかりません

具体的には、
例えば以下のようなtextファイルの中で、"strain"以降の文字を削除して
結果Bのようにしたいです
"strain"の前にスペースがありますが、このスペースも省けるとなおありがたいです
よろしくお願い致します

[処理前]

123456 aaaaa strain ccccc dhstag

atcgatcgatcgatcgatcgatcg

213456 aychan strain ggggg arcga

atcgatcgatcgatcgatcgatcgat

3425167 ahftga strain hhhhh cghsyt

sgatgstcatsgctsgtag


[結果B]

123456 aaaaa

atcgatcgatcgatcgatcgatcg

213456 aychan

atcgatcgatcgatcgatcgatcgat

3425167 ahftga

sgatgstcatsgctsgtag

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sed 's/ *strain.*$//' < input.fasta > output.fasta

投稿2020/07/16 08:17

KojiDoi

総合スコア13671

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ykyoko

2020/07/16 20:57

できました! なるほど、置換後を//にすればよかったのですね ありがとうございました
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