docker-compose upがうまくいかない

Question

前提・実現したいこと

既存のRailsアプリの開発環境をvagrantからDockerに変更したいのですが、docker-compose upがうまくいきません。
ご教授ください。

発生している問題・エラーメッセージ

Could not find nokogiri-1.10.10 in any of the sources

該当のソースコード

FROM ruby:2.6.3

RUN apt-get update && \
    apt-get install -y mariadb-client nodejs vim --no-install-recommends && \
    rm -rf /var/lib/apt/lists/*

RUN mkdir /myproject

WORKDIR /myproject

ADD Gemfile /myproject/Gemfile
ADD Gemfile.lock /myproject/Gemfile.lock

RUN gem install bundler
RUN bundle install

ADD . /myproject

version: '2'
services:
  db:
    image: mysql:5.6
    environment:
      MYSQL_ROOT_PASSWORD: password
      MYSQL_DATABASE: root
    volumes:
      - mysql-data:/var/lib/mysql    #データの永続化のために必要
    ports:
      - "4306:3306"  #両方3306でもok。詳細は下の「番外編：DBをsequel proで可視化したい」へ

  web:
    tty: true          #コンテナ上でbinding.pryするために必要
    stdin_open: true   #コンテナ上でbinding.pryするために必要
    build: .
    command: bundle exec rails s -p 3000 -b '0.0.0.0'
    volumes:
      - .:/myproject    #ローカルのディレクトリをコンテナ上にマウント
      - bundle:/usr/local/bundle    #bundle installした後buildし直さなくてよくなる
    ports:
      - "3000:3000"
    links:
      - db

volumes:
  mysql-data:
  bundle:  

default: &default
  adapter: mysql2
  encoding: utf8
  pool: <%= ENV.fetch("RAILS_MAX_THREADS") { 5 } %>
  username: root
  password: password
  host: db

development:
  <<: *default
  database: db/development.sqlite3

試したこと

gem install nokogiri

をすると

ERROR:  While executing gem ... (Gem::FilePermissionError)
    You don't have write permissions for the /Library/Ruby/Gems/2.6.0 directory.

と出ました。次に

sudo gem install nokogiri

上記コマンドを入力し、docker logsで確認すると

Could not find nokogiri-1.10.10 in any of the sources
Run `bundle install` to install missing gems.
Could not find nokogiri-1.10.10 in any of the sources
Run `bundle install` to install missing gems.

となり、bundle　installは問題なくできます。
よろしくお願いします。

Answer 1

Gemfile に次の内容を追記します:

gem 'nokogiri'

そしてビルドし直してみると、少なくともこのエラーは解消しませんか？

bundle lock
docker-compose build

また、

sudo gem install nokogiri

このコマンドを「 Docker を動かしているコンピューター」で実行していませんか？
gem をインストールする先は
「Docker を動かしているコンピューター」ではなく、
「構築しているコンテナ」である必要があります

Comments

[y_shinoda]

Gemfile.lock を更新するのを忘れていたので、
bundle lock コマンドを追加しておきました

[shin342]

bundle installのコマンドをdocker-compose run web bundle install --path vendor/bundlerに変更したら出来ました。
ありがとうございました。