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PyTorchは、オープンソースのPython向けの機械学習ライブラリ。Facebookの人工知能研究グループが開発を主導しています。強力なGPUサポートを備えたテンソル計算、テープベースの自動微分による柔軟なニューラルネットワークの記述が可能です。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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データセットクラス作成時の__init__や__getitem__の書き方がわからない

Hiro051

総合スコア9

PyTorch

PyTorchは、オープンソースのPython向けの機械学習ライブラリ。Facebookの人工知能研究グループが開発を主導しています。強力なGPUサポートを備えたテンソル計算、テープベースの自動微分による柔軟なニューラルネットワークの記述が可能です。

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投稿2020/05/30 09:44

編集2020/05/30 09:45

前提・実現したいこと

Python初心者です。

カスタムデータセットをトレーニングデータセットとテストデータセットに分割したいと考えていますが、
データセットクラス作成時の_init_や_getitem_の書き方がよくわかりません。

欠けている情報ございましたら補足いたします。
よろしくお願いいたします。

発生している問題・エラーメッセージ

$ python AlexNet.py Traceback (most recent call last): File "AlexNet.py", line 118, in <module> for i, (images, labels) in enumerate(train_loader): File "/home/selen/.pyenv/versions/3.7.3/lib/python3.7/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py", line 582, in __next__ return self._process_next_batch(batch) File "/home/selen/.pyenv/versions/3.7.3/lib/python3.7/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py", line 606, in _process_next_batch raise Exception("KeyError:" + batch.exc_msg) Exception: KeyError:Traceback (most recent call last): File "/home/selen/.pyenv/versions/3.7.3/lib/python3.7/site-packages/torch/utils/data/_utils/worker.py", line 99, in _worker_loop samples = collate_fn([dataset[i] for i in batch_indices]) File "/home/selen/.pyenv/versions/3.7.3/lib/python3.7/site-packages/torch/utils/data/_utils/worker.py", line 99, in <listcomp> samples = collate_fn([dataset[i] for i in batch_indices]) File "/home/selen/.pyenv/versions/3.7.3/lib/python3.7/site-packages/torch/utils/data/dataset.py", line 107, in __getitem__ return self.dataset[self.indices[idx]] File "AlexNet.py", line 31, in __getitem__ image = self.data[idx]["image"] KeyError: 'image'

該当のソースコード

Python

1import torch 2import torchvision 3import torch.nn as nn 4import torch.nn.init as init 5import torch.optim as optim 6import torch.nn.functional as F 7import torchvision.transforms as transforms 8import numpy as np 9from matplotlib import pyplot as plt 10from skimage import io, transform 11 12from torch.utils.data import Dataset 13from dataset import CLASS_MAP 14import dataset 15 16CLASS_MAP = {"CN": 0, "AD": 1, "LMCI": 2, "MCI": 3} 17 18class BrainData(Dataset): 19 def __init__(self, data, transform=None, class_map=CLASS_MAP): 20 self.data = data 21 self.class_map = class_map 22 self.transform = transform 23 24 def __len__(self): 25 return len(self.data) 26 27 def __getitem__(self, idx): 28 if torch.is_tensor(idx): 29 idx = idx.tolist() 30 31 image = self.data[idx]["image"] 32 label = self.class_map[self.data[idx]["label"]] 33 sample = {'image': image, "label": label} 34 35 return sample 36 37data = dataset.load_data(["ADNI2"]) 38data_set = BrainData(data, CLASS_MAP) 39 40n_train = int(len(data_set) * 0.8) 41n_val = int(len(data_set) - n_train) 42 43train_dataset, val_dataset = torch.utils.data.random_split(data_set, [n_train, n_val]) 44 45train_loader = torch.utils.data.DataLoader( 46 train_dataset, batch_size=64, shuffle=True, num_workers=4) 47 48val_loader = torch.utils.data.DataLoader( 49 val_dataset, batch_size=64, shuffle=False, num_workers=4) 50 51# set data loader 52train_loader = torch.utils.data.DataLoader( 53 dataset=train_dataset, 54 batch_size=64, 55 shuffle=True, 56 num_workers=4) 57 58val_loader = torch.utils.data.DataLoader( 59 dataset=val_dataset, 60 batch_size=64, 61 shuffle=False, 62 num_workers=4)

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getiteminit はしっかり書けています。
エラーを見ると

KeyError: 'image'

とあります。
これは、

python3

1data_set[i]

とされたとき、data_setdataのi番目のディクショナリ型の配列にimageというKeyが存在しないということです。
一度、dataを標準出力に出してみるなどして、dataがどのような構造になっているのかを確認してみてください。

投稿2020/05/30 10:48

Luke02561

総合スコア404

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Hiro051

2020/05/30 11:31

"print(data)" {'uid': 363336, 'pid': '041_S_5082', 'label': 'SMC', 'nu_label': 5, 'path': PosixPath('/home/radiology_datas/JHU-radiology/20170509/SMC/041_S_5082/half_brain_flipRL_ADNI_041_S_5082_MR_MT1__GradWarp__N3m_Br_20130314162621463_S182655_I363336_MNI.pkl'), 'voxel': array([[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.], [0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.], [0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.], ...,    (略) ..., [0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.], [0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.], [0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]], dtype=float32)}] "print(type(data))" <class 'numpy.ndarray'> ご返信ありがとうございます。 dataは上記のようになっています。
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