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Numpy配列からGIFを生成したい

Takayou

総合スコア15

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2020/05/25 13:02

Numpy配列からGIFを生成したい

CT画像からGIFを生成したいのですが, エラーが生じてしまいます.

手順

  1. PydicomでCT画像をNumpy配列に変換
  2. Numpy配列をImageオブジェクトに変換
  3. Imageオブジェクト.saveを用いてGIFを生成

2まではうまく行っていることが確認できているのですが, 3でエラーが生じてしまいます.

以下, 2と3についてのコードです.

Python

1dicom_list = [] 2shape=(512, 512, 1) 3for i in range(dicom_images.shape[0]): 4 # Numpy配列をImageオブジェクトに変換してリストに追加 5 dicom_list.append(Image.fromarray(np.uint8(dicom_images[i]))) 6print(len(dicom_list)) #169 7 8print(type(dicom_list[0])) #<class 'PIL.Image.Image'> 9print(dicom_list[0].size) #(512, 512) 10print(dicom_list[0].format) #None 11print(dicom_list[0].mode) #L 12 13 14dicom_list[0].save(os.path.join(file_path, "a.png")) # 成功 15# 下記コードでエラー発生 16dicom_list[0].save(os.path.join(file_path, "dicom.gif"), 17 save_all=True, append_images=dicom_list[1:], 18 optimize=False, 19 duration=40, 20 loop=3)

エラー内容は以下です.

AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'palette'

pngファイルへの変換は可能であることを確認済みです.

NoneタイプはGifに変換できないと言うことなのでしょうか...?
このようなケースでGifへの変換を行っている, もしくはできないので諦めなさいという資料が見つけられなかったので質問させていただきました.

GIF作成に関しては, 以下を参考にしました.
Python, PillowでアニメーションGIFを作成、保存

よろしくお願いします.

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Paletteモードを'L'から'P'に変換する必要があるみたいです.

Python

1# dicom_list.append(Image.fromarray(np.uint8(dicom_images[i]))) 2dicom_list.append(Image.fromarray(np.uint8(dicom_images[i]).convert('P'))

参考

投稿2020/05/25 13:50

Takayou

総合スコア15

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