typeperfコマンドはどうでしょう?
"(PDH-CSV 4.0)","\WIN7\Processor(_Total)% Processor Time"
"02/04/2016 20:07:56.683","1.899448"
"02/04/2016 20:08:56.683","3.217931"
"02/04/2016 20:09:56.684","1.414578"
"02/04/2016 20:10:56.689","1.556160"
"02/04/2016 20:11:56.703","1.763904"
"02/04/2016 20:12:56.716","1.611186"
"02/04/2016 20:13:56.729","2.358525"
・・・こんな感じです。
使用率をcsvで吐き出してくれるので必要なだけ読み込んで平均を取ればいいと思います。
typeperfコマンドでシステムのパフォーマンス・カウンタのデータを収集する
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