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Jupyter

Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

Matplotlib

MatplotlibはPythonのおよび、NumPy用のグラフ描画ライブラリです。多くの場合、IPythonと連携して使われます。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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ArtistAnimationで動画が表示されずに困っています。

syoshinnsya1

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Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

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投稿2020/05/18 12:47

編集2020/05/18 13:41

前提・実現したいこと

matplotlibのArtistAnimationについての質問です。
躓いているのは、おそらくとても初歩的な内容です。
jupyter notebookでロイドのアルゴリズムをアニメーションで表現しようと思っています。
元のコードは以下サイト(http://satemochi.blog.fc2.com/blog-entry-58.html)のコードを参照にしているのすが、動画になってくれません。
ソースコードを実行すると、動画が表示されるのではなくすべてのグラフが重なったようなグラフが表示されてしまいます。

発生している問題・エラーメッセージ

アニメーションにならずにグラフが重なって表示されてしまう。

該当のソースコード

コードが長いためメインの部分だけを表示しています。その他の部分は(http://satemochi.blog.fc2.com/blog-entry-58.html)のサイトを参考にしています。

if __name__ == '__main__': n = 100 #母点の個数 pts = [[random.random(), random.random()] for i in range(n)] #母点の座標をn個生成 pts = pts + [[100, 100], [100, -100], [-100, 0]] #ダミーの母点を追加 d_threshold = 0.001 #収束判定値 fig = plt.figure(figsize=(6, 6)) ax = fig.add_subplot(111) ani = [] for i in range(100): #100回以上は繰り返さない vor = Voronoi(pts) d = centroidal(vor, pts) #ボロノイ図形を計算 ani = voronoi_plot_2d(vor,ax, show_vertices=False) #ボロノイ図形を図示 ani.append(ani) if d < d_threshold: break ax.set_xlim([0, 1]) ax.set_ylim([0, 1]) ArtistAnimation(fig, ani, interval=1000) plt.show()

試したこと

コードを入れ替えたり様々なことをしたが、分からなかった。

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FuncAnimation を使います。

  1. frame 引数には、ジェネレーターが指定できるので、各イテレーションごとの Voronoi オブジェクトを返すジェネレーターを指定する。
  2. func 引数に、受け取った Voronoi オブジェクトを描画する関数を指定する。

コードにすると以下のようになります。

python

1import random 2import matplotlib.pyplot as plt 3from scipy.spatial import Voronoi, voronoi_plot_2d 4from shapely.geometry import Polygon, Point 5 6 7def centroidal(vor, pts): 8 sq = Polygon([[0, 0], [1, 0], [1, 1], [0, 1]]) 9 maxd = 0.0 10 for i in range(len(pts) - 3): 11 poly = [vor.vertices[v] for v in vor.regions[vor.point_region[i]]] 12 i_cell = sq.intersection(Polygon(poly)) 13 p = Point(pts[i]) 14 pts[i] = i_cell.centroid.coords[0] 15 d = p.distance(Point(pts[i])) 16 if maxd < d: 17 maxd = d 18 return maxd 19 20 21def process(): 22 d_threshold = 0.001 23 24 for i in range(100): 25 vor = Voronoi(pts) 26 d = centroidal(vor, pts) 27 if d < d_threshold: 28 break 29 30 yield vor 31 32 33def plot(vor): 34 ax.cla() 35 voronoi_plot_2d(vor, ax=ax, show_vertices=False) 36 ax.set_aspect("equal") 37 ax.set_xlim([0, 1]) 38 ax.set_ylim([0, 1]) 39 40 41n = 30 42pts = [[random.random(), random.random()] for i in range(n)] 43pts = pts + [[100, 100], [100, -100], [-100, 0]] 44 45fig, ax = plt.subplots(figsize=(9, 9)) 46 47# アニメーションを作成する。 48anim = FuncAnimation(fig, plot, frames=process, save_count=n) 49anim.save("animation.gif", writer="pillow")

イメージ説明

投稿2020/05/18 12:59

編集2020/05/18 14:01
tiitoi

総合スコア21956

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syoshinnsya1

2020/05/18 13:44

迅速な解答ありがとうございます。 質問内容にかなり不備がありました。 申し訳ございません。
syoshinnsya1

2020/05/18 15:29

本当にありがとうございます。 質問すると悩んでいたことがこんなに早く解決するとは思いませんでした。 基本から勉強していきたいと思います。
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