パッケージ中にあるはずの関数が見つかりません。

Question

R初心者です。
機械学習モデルのCaibrationの評価にHosmer-Lemeshow 検定を行う必要があり、ResourceSelectionパッケージのhoslem.test関数を使用するつもりでした。
ResourceSelectionをインストールした後、

library(ResourceSelection)
> library(ResourceSelection)
> n <- 500
> x <- rnorm(n)
> y <- rbinom(n, 1, plogis(0.1 + 0.5*x))
> m <- glm(y ~ x, family=binomial)
> hoslem.test(m$y, fitted(m))

のようにコード実行すると、
「hoslem.test(m$y, fitted(m)) でエラー:
関数 "hoslem.test" を見つけることができません」
とエラーが出ます。

install.packages("ResourceSelection")
 パッケージを ‘C:/Users/yaman/OneDrive/ドキュメント/R/win-library/4.0’ 中にインストールします 
 (‘lib’ が指定されていないため) 
 警告:   リポジトリー https://cran.ism.ac.jp/src/contrib に対する索引にアクセスできません :
   URL 'https://cran.ism.ac.jp/src/contrib/PACKAGES' を開けません 
 警告:   リポジトリー https://cran.ism.ac.jp/bin/windows/contrib/4.0 に対する索引にアクセスできません :
   URL 'https://cran.ism.ac.jp/bin/windows/contrib/4.0/PACKAGES' を開けません 
 警告メッセージ: 
 パッケージ ‘ResourceSelection’ が利用できません (for R version 4.0.

と警告が出る事が影響しているのではと考えていますが、なぜ利用できないのかがわかりません。

R初心者なので、とても基本的なことを間違っているのかもしれませんが、気が付かれたことを教えて頂けるとありがたいです。

Answer 1

cran.ism.ac.jpは現在ダウンしていてアクセスできません。したがってパッケージはインストールできていないはずです。

ミラーサイトのリストから適当なサイトを選んでインストールを試みてください。サイトの指定方法は、RjpWikiにまとめられています。

Comments

[SyunSyun]

早速の回答ありがとうございます。
知りませんでした。そのミラーサイトはDownしていたのですか。ご教授していただきありがとうございます。

ミラーサイトを変更し、ResourceSelectionをインストールした後、前回までと違った
「URL 'https://cran.seoul.go.kr/bin/windows/contrib/4.0/ResourceSelection_0.3-5.zip' を試しています
Content type 'application/zip' length 508710 bytes (496 KB)
downloaded 496 KB
パッケージ ‘ResourceSelection’ は無事に展開され、MD5 サムもチェックされました
ダウンロードされたパッケージは、以下にあります
C:\Users\yaman\AppData\Local\Temp\RtmpaUW6FJ\downloaded_packages 」という表示がされ、無事インストールされたと思います。

ただ、その後上記のような問題点は改善せず
> library(ResourceSelection)
> n <- 500
> x <- rnorm(n)
> y <- rbinom(n, 1, plogis(0.1 + 0.5*x))
> m <- glm(y ~ x, family=binomial)
> hoslem.test(m$y, fitted(m))　とすると　
hoslem.test()のところで
「hoslem.test(m$y, fitted(m)) でエラー:
関数 "hoslem.test" を見つけることができません」と同様に表示され回答がえられません。
さらに気が付かれる点があればご教授頂けるとありがたいです。

[KojiDoi]

library()
で、ちゃんとresourceSelectionが表示されますか?

[SyunSyun]

素早い回答ありがとうございます
library()で
パッケージ （ライブラリ ‘C:/Users/yaman/OneDrive/ドキュメント/R/win-library/4.0’ 中):

openxlsx Read, Write and Edit xlsx Files
pbapply Adding Progress Bar to '*apply' Functions
plyr Tools for Splitting, Applying and Combining
Data
pROC Display and Analyze ROC Curves
Rcpp Seamless R and C++ Integration
ResourceSelection Resource Selection (Probability) Functions
for Use-Availability Data
stringi Character String Processing Facilities
zip Cross-Platform 'zip' Compression

パッケージ （ライブラリ ‘C:/Program Files/R/R-4.0.0/library’ 中):

base The R Base Package
boot Bootstrap Functions (Originally by Angelo
Canty for S)
class Functions for Classification
cluster "Finding Groups in Data": Cluster Analysis
Extended Rousseeuw et al.
codetools Code Analysis Tools for R
compiler The R Compiler Package
datasets The R Datasets Package
foreign Read Data Stored by 'Minitab', 'S', 'SAS',
'SPSS', 'Stata', 'Systat', 'Weka', 'dBase',
...
graphics The R Graphics Package
grDevices The R Graphics Devices and Support for
Colours and Fonts
grid The Grid Graphics Package
KernSmooth Functions for Kernel Smoothing Supporting
Wand & Jones (1995)
lattice Trellis Graphics for R
MASS Support Functions and Datasets for Venables
and Ripley's MASS
Matrix Sparse and Dense Matrix Classes and Methods
methods Formal Methods and Classes
mgcv Mixed GAM Computation Vehicle with Automatic
Smoothness Estimation
nlme Linear and Nonlinear Mixed Effects Models
nnet Feed-Forward Neural Networks and Multinomial
Log-Linear Models
parallel Support for Parallel computation in R
rpart Recursive Partitioning and Regression Trees
spatial Functions for Kriging and Point Pattern
Analysis
splines Regression Spline Functions and Classes
stats The R Stats Package
stats4 Statistical Functions using S4 Classes
survival Survival Analysis
tcltk Tcl/Tk Interface
tools Tools for Package Development
translations The R Translations Package
utils The R Utils Package

となり、ResourceSelectionは表示されているようです。