OpenCVで検出した輪郭をトリミングしたい

Opencvを利用し楽譜の画像を読み込み五線譜の輪郭をなんとなくとることができたのですが、これをそれぞれの囲みごとにトリミングしたいのですが方法が分かりません。
やろうと思ったのは Imgproc.findContoursで得た座標を使ってトリミングしようと思ったのですが具体的に何を使用すればよいかわかりません。どうかお願いします。

ソース

java
1 cvtColor(mat, mat, COLOR_RGB2GRAY);
2                                Photo.fastNlMeansDenoising(mat, den, 6, 7, 21);
3                                Imgproc.adaptiveThreshold(den, adp, 255, Imgproc.ADAPTIVE_THRESH_GAUSSIAN_C, Imgproc.THRESH_BINARY, 17, 2);
4                                Core.bitwise_not(adp, bin);
5                                Mat linesMat = new Mat();
6                                Imgproc.HoughLinesP(bin, linesMat, 1d, Math.PI / 360d, 200, 100d, 23);
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9                                Mat bmpmat = new Mat();
10                                Utils.bitmapToMat(bmp, bmpmat);
11                                double[] data;
12                                Point pt1 = new Point();
13                                Point pt2 = new Point();
14                                int rouws = linesMat.rows();
15                                for (int i = 0; i < rouws; i++) {
16                                    data = linesMat.get(i, 0);
17                                    pt1.x = data[0];
18                                    pt1.y = data[1];
19                                    pt2.x = data[2];
20                                    pt2.y = data[3];
21                                    Imgproc.line(bmpmat, pt1, pt2, new Scalar(255, 0, 0), 18);
22                                }
23                                cvtColor(bmpmat, bmpmat, COLOR_RGB2GRAY);
24                                Core.bitwise_not(bmpmat,mat_output);
25                                List<MatOfPoint> contours = new ArrayList<MatOfPoint>();
26                                Mat hierarchy = new Mat();
27                                Imgproc.findContours(mat_output, contours, hierarchy, Imgproc.RETR_EXTERNAL, Imgproc.CHAIN_APPROX_TC89_L1);
28                                Imgproc.drawContours(mat, contours, -1, new Scalar(0, 255, 0), 1);