GraphViz's executables not foundが消えない

前提・実現したいこと

決定木の画像を表示させたい。

発生している問題・エラーメッセージ

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InvocationException                       Traceback (most recent call last)
<ipython-input-62-b26f7f7bce24> in <module>
     12                            out_file=None) 
     13 graph = graph_from_dot_data(dot_data)
---> 14 graph.write_png('tree.png')

~\anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in <lambda>(path, f, prog)
   1808                 lambda path,
   1809                 f=frmt,
-> 1810                 prog=self.prog: self.write(path, format=f, prog=prog)
   1811             )
   1812 

~\anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in write(self, path, prog, format)
   1916 
   1917             else:
-> 1918                 fobj.write(self.create(prog, format))
   1919         finally:
   1920             if close:

~\anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in create(self, prog, format)
   1958             if self.progs is None:
   1959                 raise InvocationException(
-> 1960                     'GraphViz\'s executables not found')
   1961 
   1962         if prog not in self.progs:

InvocationException: GraphViz's executables not found

該当のソースコード

Python
1from pydotplus import graph_from_dot_data
2from sklearn.tree import export_graphviz
3
4dot_data = export_graphviz(tree,
5                           filled=True, 
6                           rounded=True,
7                           class_names=['Setosa', 
8                                        'Versicolor',
9                                        'Virginica'],
10                           feature_names=['petal length', 
11                                          'petal width'],
12                           out_file=None) 
13graph = graph_from_dot_data(dot_data) 
14graph.write_png('tree.png')

試したこと

pathの確認
"C:\Users\user\anaconda3\Library\bin\graphviz"にファイルが保存されていました。

補足情報（ツールのバージョンなど）

anaconda JupiterLab 1.2.6

tiitoi

2020/05/03 05:42

graphviz 本体のインストールと環境変数 PATH の登録が必要です。 Mac だと brew を使えば、簡単にインストールできると思います。「brew graphviz」で調べると情報が出てくると思います。(自分は Mac は持っていないので、ここに手順はかけません)

os-t

2020/05/04 05:05

本体のインストールとユーザー環境変数の欄に"C:\Users\user\anaconda3\Library\bin\graphviz"を追加しましたが、できませんでした。いろいろ調べるとdot.extを追加すればよい。と出てきたのですが、なんのdot.extを追加すればよいのかわからないです。 Windowsを使っています。

tiitoi

2020/05/04 07:12

回答した手順でどうでしょうか。なお、Path に追加するやり方がわからない場合は以下を参照してください。 https://qiita.com/shuhey/items/7ee0d25f14a997c9e285

行動規範の内容に同意します

回答1件

ベストアンサー

Windowsを使っています。

Windows であれば、

graphviz の公式サイトから「graphviz-2.38.msi」をダウンロードしてインストール
graphviz のバイナリ dot.exe があるディレクトリを環境変数 Path へ追加 (デフォルトの場所: C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin)

正常に追加できていれば、追加後にコマンドプロンプトを起動し、where dot と入力すれば、パスが表示されるはずです。

「情報: 与えられたパターンのファイルが見つかりませんでした。」とエラーになる場合は、Path の追加が上手くできていません。
3. Jupyter Notebook を再起動
上記手順で graphviz を使用する Python のライブラリを使えるようになっていると思います。