Q&A
> cyberduck上に作成したファイル
というのは、cyberduck で、sftp 等でリモート側サーバーに送信したファイルのことでしょうか？
vagrant と Cyberduck の接続先は同じですか？
環境
macOS:Yosemite 10.10.5
Vagrant:1.7.2
VirtualBox:4.3.26
Cyberduck:7.2.5
やりたいこと
cyberduck上に作成したファイル（php,ruby,txt）の内容表示（helloなど）による操作確認
（ローカル開発環境の構築 [macOS編]に従って操作）
問題
・vagrantによりcyberduck接続下で、ターミナルよりファイルの実行を支持してもなにも生じない（エラー表示も出ない）。
やってみたこと
・ターミナルからcyberduckのディレクトリ操作（ファイル、フォルダの作成、削除、移動など）→可能
ファイル自体の実行が不可
ご連絡ありがとうございます。以下で答えになっていますでしょうか？
”cyberduck上に作成したファイル”というのは、cyberduck で、sftp 等でリモート側サーバーに送信したファイルのことでしょうか？
>stfp新規接続したcyberduck上（これがリモート側サーバー？）に直接作成しました。
vagrant と Cyberduck の接続先は同じですか？
>共に192.168.33.10と設定しています。
具体的に実行したコマンドを記載していただけないでしょうか？
わかりにくくてすみません。
まだ初期設定をして動作テストをしているだけなのですが以下の通りです。
①Cyberduck接続設定
新規接続→プロトコル：SFTP選択→サーバー設定：192.168.33.10→ユーザー名:vagrant
②ファイル実行操作（例としてruby）
1.Cyberduck上のhome/vagrantフォルダにruby_lessonsというフォルダ作成
2.ruby_lessonsフォルダ内にファイルhello.rb作成
3.hello.rbをatomで開き{puts "hello"}と入力、保存
4.ターミナルで仮想マシンにログインした上で、ruby_lessonsフォルダへの移動指示
$cd ruby_lessons
$ls
>hello.rb
5.hello rbを実行
$ruby hello.rb
>なにも生じず、エラーもなし。
質問の通り、ディレクトリ操作はできている（→接続はok?）のに、ファイル実行が不可という状況です。
Cyberduck はファイル転送ソフトなので、「Cyberduck 上のファイル」というのはおかしいです。ホスト（Mac）側にあるかゲスト（仮想マシン）側にあるかどっちかなので、そこの区別をちゃんとしないと何を言ってるのかさっぱりです。
とりあえず、仮想マシンで cat hello.rb とかして、hello.rb の内容を確認しましょう。
ご連絡ありがとうございます。
承知しました。
vagrantで立ち上げた仮想マシンへのアクセスを試みている状況です。
接続設定や仮想マシン側にあるファイルについて作成、移動などはできますが、ファイルの実行ができません。
cat hello.rbも実行できませんでした。
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