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Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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Python argument types in MolDraw2D.DrawMolecules(MolDraw2DSVG, list) did not match C++ エラー

tyuunibyou

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投稿2020/03/14 07:53

プログラミング初心者です。
minicondaでRDKiTを進めていたところ以下のエラーが出ました。
エラー解決するためhttps://github.com/rdkit/rdkit/issues/715
のサイトを参考にして試してみましたが解決できませんでした。
解決策を教えてください

python

1 2ht = HeteroShuffle(mol1, core1) 3res = ht.generate_mols() 4print(len(res)) 5Draw.MolsToGridImage(res, molsPerRows=5) 6 77 80 9 10 11--------------------------------------------------------------------------- 12ArgumentError Traceback (most recent call last) 13<ipython-input-24-f39904f95965> in <module> 14 2 res = ht.generate_mols() 15 3 print(len(res)) 16----> 4 Draw.MolsToGridImage(res, molsPerRows=5) 17 18 19~\Miniconda3\lib\site-packages\rdkit\Chem\Draw\IPythonConsole.py in ShowMols(mols, maxMols, **kwargs) 20 191 if prop in kwargs: 21 192 kwargs[prop] = kwargs[prop][:maxMols] 22--> 193 res = fn(mols, drawOptions=drawOptions, **kwargs) 23 194 if kwargs['useSVG']: 24 195 return SVG(res) 25 26~\Miniconda3\lib\site-packages\rdkit\Chem\Draw\__init__.py in MolsToGridImage(mols, molsPerRow, subImgSize, legends, highlightAtomLists, highlightBondLists, useSVG, **kwargs) 27 491 return _MolsToGridSVG(mols, molsPerRow=molsPerRow, subImgSize=subImgSize, legends=legends, 28 492 highlightAtomLists=highlightAtomLists, 29--> 493 highlightBondLists=highlightBondLists, **kwargs) 30 494 else: 31 495 return _MolsToGridImage(mols, molsPerRow=molsPerRow, subImgSize=subImgSize, legends=legends, 32 33~\Miniconda3\lib\site-packages\rdkit\Chem\Draw\__init__.py in _MolsToGridSVG(mols, molsPerRow, subImgSize, legends, highlightAtomLists, highlightBondLists, drawOptions, **kwargs) 34 473 del kwargs[k] 35 474 d2d.DrawMolecules(list(mols), legends=legends, highlightAtoms=highlightAtomLists, 36--> 475 highlightBonds=highlightBondLists, **kwargs) 37 476 d2d.FinishDrawing() 38 477 res = d2d.GetDrawingText() 39 40ArgumentError: Python argument types in 41 MolDraw2D.DrawMolecules(MolDraw2DSVG, list) 42did not match C++ signature: 43 DrawMolecules(class RDKit::MolDraw2D {lvalue} self, class boost::python::api::object mols, class boost::python::api::object highlightAtoms=None, class boost::python::api::object highlightBonds=None, class boost::python::api::object highlightAtomColors=None, class boost::python::api::object highlightBondColors=None, class boost::python::api::object highlightAtomRadii=None, class boost::python::api::object confIds=None, class boost::python::api::object legends=None) 44
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