共通JS内のスムーススクロールを発火させない方法

前提・実現したいこと

大きな本体サイトの中で展開される特定の特集サイトを制作しています。
本体サイトの中で展開されるため、本体サイト用の共通CSS・JSを読み込んでから、
特集サイト用のCSS・JSを読み込む構造となっています。

特集サイトでは独自の固定ヘッダーが発生するため、
スムーススクロール時に位置を調整するようにしているのですが、
共通JSの中に位置調整のない普通のスムーススクロールの記述があり、
先にそちらが発火して一旦移動してから、再度位置調整でスクロールするような動きになってしまいます。
これを、直接位置調整された場所にスムーススクロールで移動させたいです。

発生している問題・エラーメッセージ

エラーメッセージは特にありません。
一度href="#xxx"で指定された場所にスクロールしてから、
少し上に戻るような挙動になってしまいます。

該当のソースコード

▼本サイト側のスムーススクロール

JavaScript
1$('a[href^="#"]').click(function(){
2	var speed = 500;
3	var href= $(this).attr("href");
4	var target = $(href == "#" || href == "" ? 'html' : href);
5	var position = target.offset().top;
6		$("html, body").animate({scrollTop:position}, speed, "swing");
7	return false;
8	});
9});

▼特集サイト側のスムーススクロール

JavaScript
1  $('a[href^="#"]:not(".no-scroll")').on("click",function(e){
2    var speed = 800;
3    var href= $(this).attr("href");
4    var target = $(href == "#" || href == "" ? 'html' : href);
5    var position = target.offset().top-200;
6    $('body,html').animate({scrollTop:position}, speed, 'swing');
7    return false;
8  });