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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

Q&A

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ブートストラップ法によるoptimism計算について

YKBO

総合スコア4

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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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投稿2020/02/17 17:33

編集2020/02/18 01:33

前提・実現したいこと

モデルとブートストラップによるROC曲線の比較をしたくて(internal validation)、下記の関数入力をしています。
Optimismを調べるためにc統計値の差を調べるべく compare_aucを使っています。

データ名:X0618_2

ロジスティック回帰分析:BD~ Age65 + Bystander + witness +etiology

compare_auc <- function(formula1, formula2, X0618_2, response, alternative="two.sided"){

  • olm1 <- glm(formula1, data=X0618_2, family="binomial")
  • olm2 <- glm(formula2, data=X0618_2, family="binomial")
  • ROC_1 <- pROC::roc(response=response, predictor=fitted(olm1))
  • ROC_2 <- pROC::roc(response=response, predictor=fitted(olm2))
  • print(pROC::roc.test(ROC_1, ROC_2, method="delong", alternative=alternative))
  • print(pROC::roc.test(ROC_1, ROC_2, method = "bootstrap", boot.n = 2000, progress="none", alternative=alternative))}

compare_auc(BD~ Age65 + Bystander + witness +etiology,as.data.X0618_2,X0618_2$BD,"less")

発生している問題・エラーメッセージ 

エラーメッセージ ```eval(predvars, data, env) でエラー: 数値の 'envir' 引数の長さが 1 ではありません ### 該当のソースコード ```R ソースコード

http://freeverb3vst.osdn.jp/sodan/tips/r3.html

試したこと

AUCが出ません。
"less"のところを何かに書き換えるべきかわかりません。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

ここにより詳細な情報を記載してください。ぶn

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kei344

2020/02/17 17:46

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