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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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585閲覧

ピアソンとスピアマンの相関を混ぜて相関マトリクスを作る方法

instantuser

総合スコア11

R

R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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投稿2020/01/23 06:16

いつもお世話になっております。

Rにて相関マトリクスを作りたいのですが、量的データと質的データが混ざっています。
量的データのみでしたら、以下のHPのように作れるのは調べて分かったのですが、
両者が混ざっている場合はどうしたらよいでしょうか?一度に図に纏めることはできますか?

参考にしたHP
http://www.sthda.com/english/wiki/scatter-plot-matrices-r-base-graphs

library(psych)
pairs.panels(iris[,-5],
method = "pearson", # correlation method
hist.col = "#00AFBB",
density = TRUE, # show density plots
ellipses = TRUE # show correlation ellipses
)

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shimiken

2020/01/26 00:02

「一度に図に纏める」の意図がちょっとわかりにくいです。 method = "pearson"で作った図と method = "spearman"で作った図を2つ並べるのではダメですか?
instantuser

2020/03/04 02:35

質的データとの相関はスピアマン、量的データ同士ならピアソンといった感じです (めっちゃ遅くなってすみません)
shimiken

2020/03/04 03:45

例えば iris[1:2]はmethod = "pearson"にして iris[3:4]はmethod = "spearman"にしたいという意味ですか?
shimiken

2020/03/14 07:15

量的データと質的データとの比較の場合はpearsonとspearmanのどちらを使いますか?
guest

回答1

0

ベストアンサー

iris[,2]とiris[,3]が量的データで、iris[,1]とiris[,4]が質的データとした場合

R

1library(psych) 2pairs.panels(iris[,-5], 3 method = "spearman", # correlation method 4 hist.col = "#00AFBB", 5 density = TRUE, # show density plots 6 ellipses = FALSE # show correlation ellipses 7) 8polygon(c(0.51,0.7,0.7,0.51),c(0.55,0.55,0.7,0.7),col="white", border = "white") 9a<-cor.test(iris[,2],iris[,3],method = "pearson")$estimate 10text(0.6,0.6,format(a,digits = 2),cex=3)

かなり泥臭いやり方ですが、、、、とりあえず。
相関楕円も描きたい場合は同じような作戦で上書きすればよいです。

ちなみに。どのようなデータを扱っているかわかりませんが、
量的データもひっくるめて全部spearmanにしてもいいと思います。
pearsonは(1)母集団の正規分布を前提にしている、(2)非線形の相関に弱いという弱点があります。

投稿2020/03/14 09:26

shimiken

総合スコア368

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instantuser

2020/03/14 11:53

ありがとうございました!意味を完全には理解していませんが、これから勉強します!
guest

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