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ピアソンとスピアマンの相関を混ぜて相関マトリクスを作る方法

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いつもお世話になっております。

Rにて相関マトリクスを作りたいのですが、量的データと質的データが混ざっています。
量的データのみでしたら、以下のHPのように作れるのは調べて分かったのですが、
両者が混ざっている場合はどうしたらよいでしょうか?一度に図に纏めることはできますか?

参考にしたHP
http://www.sthda.com/english/wiki/scatter-plot-matrices-r-base-graphs

library(psych)
pairs.panels(iris[,-5], 
method = "pearson", # correlation method
hist.col = "#00AFBB",
density = TRUE,  # show density plots
ellipses = TRUE # show correlation ellipses
)

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  • instantuser

    2020/03/14 16:06

    https://i.stack.imgur.com/RAe5q.png
    このような図を作成して、質的データとの相関の所だけスピアマンの相関係数が出るといいんですが・・

    キャンセル

  • shimiken

    2020/03/14 16:15

    量的データと質的データとの比較の場合はpearsonとspearmanのどちらを使いますか?

    キャンセル

  • instantuser

    2020/03/14 17:49

    speamanですね

    キャンセル

回答 1

checkベストアンサー

0

iris[,2]とiris[,3]が量的データで、iris[,1]とiris[,4]が質的データとした場合

library(psych)
pairs.panels(iris[,-5], 
             method = "spearman", # correlation method
             hist.col = "#00AFBB",
             density = TRUE,  # show density plots
             ellipses = FALSE # show correlation ellipses
)
polygon(c(0.51,0.7,0.7,0.51),c(0.55,0.55,0.7,0.7),col="white", border = "white")
a<-cor.test(iris[,2],iris[,3],method = "pearson")$estimate
text(0.6,0.6,format(a,digits = 2),cex=3)


かなり泥臭いやり方ですが、、、、とりあえず。
相関楕円も描きたい場合は同じような作戦で上書きすればよいです。

ちなみに。どのようなデータを扱っているかわかりませんが、
量的データもひっくるめて全部spearmanにしてもいいと思います。
pearsonは(1)母集団の正規分布を前提にしている、(2)非線形の相関に弱いという弱点があります。

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  • 2020/03/14 20:53

    ありがとうございました!意味を完全には理解していませんが、これから勉強します!

    キャンセル

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