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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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無向グラフで重複したエッジを統合したい

restructure

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R言語は、「S言語」をオープンソースとして実装なおした、統計解析向けのプログラミング言語です。 計算がとても速くグラフィックも充実しているため、数値計算に向いています。 文法的には、統計解析部分はS言語を参考にしており、データ処理部分はSchemeの影響を受けています。 世界中の専門家が開発に関わり、日々新しい手法やアルゴリズムが追加されています。

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投稿2019/11/20 12:22

編集2019/11/21 12:59

前提・実現したいこと

igraphにより無向グラフを描画する際、重複したエッジを統合する方法を知りたく思っています。

具体的には、下記のコードを実行すると表示される以下の図について、「2」と「3」のノードから出ている二つのエッジをまとめて表示したいと思っています。

その際、単に1本にまとめるのではなく、エッジの本数分(この場合は2本分)の太さにしたいと思っております。
イメージ説明

該当のソースコード

R

1library("igraph") 2g<-matrix(c( 31,1,1,0, 41,2,2,1, 51,2,2,1, 60,1,1,1), 7nrow=4,ncol=4,byrow=TRUE) 8g <- graph.adjacency(g, mode = "undirected", diag = FALSE) 9plot(g)

試したこと

以下のコードを実行すると1本にまとめることはできましたが、エッジの本数分の太さにすることはできませんでした。

R

1g <- simplify(g, remove.multiple = T)

エッジの太さは、plot()を実行する際にedge.widthで調整できることまでは分かりました。

R

1plot(g,edge.width=)

初歩的な質問かもしれず恐縮ですが、どうぞよろしくお願いいたします。

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自己解決

以下の方法で解決することができました。お騒がせしました。

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1library(igraph) 2g<-graph_from_adjacency_matrix( 3matrix(c( 41,1,1,0, 51,2,2,1, 61,2,2,1, 70,1,1,1), 8nrow=4,ncol=4,byrow=TRUE), 9mode="undirected",weighted=TRUE,diag=FALSE) 10ew <- abs(E(g)$weight)*2 11plot(g,edge.width = ew)

イメージ説明

ポイントは以下の通りです。

  • graph_from_adjacency_matrix()関数を用いる。
  • エッジの太さを多重辺の本数分にするため、「ew <- abs(E(g)$weight)*2」を用意する。

また、plot()で出力する際にedge.width=ewで記述する。

投稿2019/11/23 04:43

編集2019/11/23 04:45
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