macOS Catalina 10.15にアップデートしてからrailsコマンドが使えない。bundle installでエラーが出る

Question

前提・実現したいこと

macOS Catalina 10.15にアップデートしてから、railsコマンドが使えないため、これを解決したいです。
bundle install実行中にエラーが発生してしまいます。

発生している問題・エラーメッセージ

railsコマンドを叩くとこのように表示されます。

Could not find libv8-3.16.14.19 in any of the sources
Run `bundle install` to install missing gems.

bundle installの実行結果が以下です。

Warning: the running version of Bundler (1.17.2) is older than the version that created the lockfile (1.17.3). We suggest you upgrade to the latest version of Bundler by running `gem install bundler`.
Fetching gem metadata from https://rubygems.org/......
Using rake 12.3.3
（略）
Using kaminari 1.1.1
Fetching libv8 3.16.14.19
Installing libv8 3.16.14.19 with native extensions
Gem::Ext::BuildError: ERROR: Failed to build gem native extension.

    current directory: /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/ext/libv8
/System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/2.6/usr/bin/ruby -I /System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/2.6/usr/lib/ruby/2.6.0 -r ./siteconf20191025-1127-h3rg3y.rb extconf.rb
creating Makefile
Applying /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/patches/disable-building-tests.patch
Applying /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/patches/disable-werror-on-osx.patch
Applying /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/patches/disable-xcode-debugging.patch
Applying /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/patches/do-not-imply-vfp3-and-armv7.patch
Applying /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/patches/do-not-use-MAP_NORESERVE-on-freebsd.patch
Applying /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/patches/do-not-use-vfp2.patch
Applying /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/patches/fPIC-for-static.patch
Compiling v8 for x64
Using python 2.7.16
Using compiler: c++ (clang version 11.0.0)
Unable to find a compiler officially supported by v8.
It is recommended to use GCC v4.4 or higher
Beginning compilation. This will take some time.
Building v8 with env CXX=c++ LINK=c++  /usr/bin/make x64.release ARFLAGS.target=crs werror=no
GYP_GENERATORS=make \
	build/gyp/gyp --generator-output="out" build/all.gyp \
	              -Ibuild/standalone.gypi --depth=. \
	              -Dv8_target_arch=x64 \
	              -S.x64  -Dv8_enable_backtrace=1 -Dv8_can_use_vfp2_instructions=true -Darm_fpu=vfpv2 -Dv8_can_use_vfp3_instructions=true -Darm_fpu=vfpv3 -Dwerror=''
  CXX(target) /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/vendor/v8/out/x64.release/obj.target/preparser_lib/src/allocation.o
warning: include path for stdlibc++ headers not found; pass '-stdlib=libc++' on the command line to use the libc++ standard library instead [-Wstdlibcxx-not-found]
In file included from ../src/allocation.cc:33:
../src/utils.h:33:10: fatal error: 'climits' file not found
#include <climits>
         ^~~~~~~~~
1 warning and 1 error generated.
make[1]: *** [/Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/vendor/v8/out/x64.release/obj.target/preparser_lib/src/allocation.o] Error 1
make: *** [x64.release] Error 2
/Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/ext/libv8/location.rb:36:in `block in verify_installation!': libv8 did not install properly, expected binary v8 archive
'/Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/vendor/v8/out/x64.release/obj.target/tools/gyp/libv8_base.a'to exist, but it was not found
(Libv8::Location::Vendor::ArchiveNotFound)
	from /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/ext/libv8/location.rb:35:in `each'
	from /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/ext/libv8/location.rb:35:in `verify_installation!'
	from /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19/ext/libv8/location.rb:26:in `install!'
	from extconf.rb:7:in `<main>'

extconf failed, exit code 1

Gem files will remain installed in /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/gems/libv8-3.16.14.19 for inspection.
Results logged to /Users/ユーザ名/フォルダ名/フォルダ名/vendor/bundle/ruby/2.6.0/extensions/universal-darwin-19/2.6.0/libv8-3.16.14.19/gem_make.out

An error occurred while installing libv8 (3.16.14.19), and Bundler cannot continue.
Make sure that `gem install libv8 -v '3.16.14.19' --source 'https://rubygems.org/'` succeeds before bundling.

In Gemfile:
  therubyracer was resolved to 0.12.3, which depends on
    libv8

指示通りgem install libv8 -v '3.16.14.19' --source 'https://rubygems.org/'を実行した結果がこちらです。

ERROR:  While executing gem ... (Gem::FilePermissionError)
    You don't have write permissions for the /Library/Ruby/Gems/2.6.0 directory.

試したこと

https://teratail.com/questions/218281
こちらと、いただいたご回答から、
・~/.zshrcファイルを作り、

if which rbenv > /dev/null; then eval "$(rbenv init -)"; fi
export PATH="$HOME/.rbenv/bin:$PATH"
eval "$(rbenv init -)"

を記述。

・source ~/.zshrcを実行し、which ruby の実行結果が
/usr/bin/rubyから/Users/ユーザ名/.rbenv/shims/ruby
に変わった

・brew install rbenv ruby-buildを実行してからbundle installを実行したが、
実行結果は変わらず、続いてエラーメッセージで指示された
gem install mysql2 -v '0.4.10' --source 'https://rubygems.org/'
を実行した結果が以下のとおりです。

Building native extensions.  This could take a while...
ERROR:  Error installing mysql2:
	ERROR: Failed to build gem native extension.

    current directory: /Users/ユーザ名/.rbenv/versions/2.3.6/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/mysql2-0.4.10/ext/mysql2
/Users/ユーザ名/.rbenv/versions/2.3.6/bin/ruby -r ./siteconf20191025-5257-9uxwbc.rb extconf.rb
checking for rb_absint_size()... yes
checking for rb_absint_singlebit_p()... yes
checking for ruby/thread.h... yes
checking for rb_thread_call_without_gvl() in ruby/thread.h... yes
checking for rb_thread_blocking_region()... no
checking for rb_wait_for_single_fd()... yes
checking for rb_hash_dup()... yes
checking for rb_intern3()... yes
checking for rb_big_cmp()... yes
-----
Using mysql_config at /usr/local/bin/mysql_config
-----
checking for mysql.h... yes
checking for errmsg.h... yes
checking for SSL_MODE_DISABLED in mysql.h... yes
checking for SSL_MODE_PREFERRED in mysql.h... yes
checking for SSL_MODE_REQUIRED in mysql.h... yes
checking for SSL_MODE_VERIFY_CA in mysql.h... yes
checking for SSL_MODE_VERIFY_IDENTITY in mysql.h... yes
checking for MYSQL.net.vio in mysql.h... yes
checking for MYSQL.net.pvio in mysql.h... no
checking for MYSQL_ENABLE_CLEARTEXT_PLUGIN in mysql.h... yes
-----
Don't know how to set rpath on your system, if MySQL libraries are not in path mysql2 may not load
-----
-----
Setting libpath to /usr/local/Cellar/mysql/5.7.19/lib
-----
creating Makefile

To see why this extension failed to compile, please check the mkmf.log which can be found here:

  /Users/ユーザ名/.rbenv/versions/2.3.6/lib/ruby/gems/2.3.0/extensions/x86_64-darwin-17/2.3.0-static/mysql2-0.4.10/mkmf.log

current directory: /Users/ユーザ名/.rbenv/versions/2.3.6/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/mysql2-0.4.10/ext/mysql2
make "DESTDIR=" clean

current directory: /Users/ユーザ名/.rbenv/versions/2.3.6/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/mysql2-0.4.10/ext/mysql2
make "DESTDIR="
compiling infile.c
compiling client.c
compiling mysql2_ext.c
compiling statement.c
compiling result.c
result.c:326:40: warning: incompatible pointer types assigning to 'my_bool *' (aka 'char *') from 'bool *' [-Wincompatible-pointer-types]
    wrapper->result_buffers[i].is_null = &wrapper->is_null[i];
                                       ^ ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
result.c:328:40: warning: incompatible pointer types assigning to 'my_bool *' (aka 'char *') from 'bool *' [-Wincompatible-pointer-types]
    wrapper->result_buffers[i].error   = &wrapper->error[i];
                                       ^ ~~~~~~~~~~~~~~~~~~
2 warnings generated.
linking shared-object mysql2/mysql2.bundle
ld: library not found for -lssl
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
make: *** [mysql2.bundle] Error 1

make failed, exit code 2

Gem files will remain installed in /Users/ユーザ名/.rbenv/versions/2.3.6/lib/ruby/gems/2.3.0/gems/mysql2-0.4.10 for inspection.
Results logged to /Users/ユーザ名/.rbenv/versions/2.3.6/lib/ruby/gems/2.3.0/extensions/x86_64-darwin-17/2.3.0-static/mysql2-0.4.10/gem_make.out

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

OS：macOS Catalina 10.15
ruby -v：ruby 2.6.3p62 (2019-04-16 revision 67580) [universal.x86_64-darwin19]
rbenv -v：rbenv 1.1.2

初心者で、ご回答に何度も追加質問することもあるかもしれませんが、よろしくお願いします。

Answer 1

zshrcの編集方法がわからない（ロックがかかっている）

「ロックがかかっている」とはどういうことですか？
which の結果より、原因はあたっていると思います。

Comments

[kotahayashi]

ご回答いただきありがとうございます。
mac全体でzshrcを検索したところ、
Macintosh HD > private > etc 内にテキストエディット書類としてzshrcというファイルが見つかりました。
zshrc_Apple_Terminalというファイルもあります。

こちらのzshrcというファイルですが、
ロックを解除しようとすると
「ファイル“zshrc”のロックを解除するために必要なアクセス権がありません。」、
編集しようとすると
「あなたはファイル“zshrc”の所有者ではなく、そのファイルに書き込む権限がありません。」
と表示されてしまいます。

そもそも編集する対象はこちらのファイルで良いのでしょうか。
よろしくお願いいたします。

[退会済みユーザー]

編集するのは `zshrc` ではなく、`.zshrc` です。
ホームディレクトリにあるはずです。
Finderからだと不可視になっているかもしれません。

[kotahayashi]

hoge@fugaMac ~ % ls
Applications Documents Library Music Public go work
Desktop Downloads Movies Pictures container learn
hoge@fugaMac ~ % pwd
/Users/hoge
ホームディレクトリはこちらでしょうか？大変初歩的なご質問で恐縮です。

[退会済みユーザー]

そこで間違いないです。

ホームディレクトリに移動するコマンドは、 `cd` です (`cd` とだけ入力して実行する）。

[kotahayashi]

ありがとうございます。
おかげさまでwhich rubyの実行結果は/Users/ユーザ名/.rbenv/shims/rubyに変わりました。
ただ、根本の解決にはまだ至っていません。
質問を編集したのでご覧いただければ幸いです。

[退会済みユーザー]

xcode-select --install

を実行して、再度 bundle install したらどうなるでしょうか。

[kotahayashi]

xcode-select --install
xcode-select: error: command line tools are already installed, use "Software Update" to install updates

Software Update
zsh: command not found: Software

それぞれこのように返ってきてしまいます。

関係あるかわかりませんが、昨日xcode自体はapple storeからインストールしました。

[退会済みユーザー]

xcodeについては OK です。
以下のコマンドを実行してから bundle install を行ったらどうでしょうか。
なおこのコマンドを実行しても、影響はアプリ内の小さな範囲に収まるので問題ないです。

bundle config --local build.mysql2 "--with-ldflags=-L/usr/local/opt/openssl/lib"

[kotahayashi]

You are replacing the current local value of build.mysql2, which is currently nil
と返ってきた後bundle installに成功しました！

これで通常の開発に戻れます。ご丁寧に回答していただき、ありがとうございました。

[退会済みユーザー]

上記のコマンドを実行する前にmysql2がビルドできなかった理由は、MacにインストールされているMySQLのバージョンが8だからです（詳細は省略します）。

これまで問題がなければ明示的に5を使っていたのでしょう。そして何らかを機にして8が入ったのでしょう。

なお、Mac以外でデフォルトで8を入れている例を知らないので、上記コマンドは今のところほとんど実行する必要はないかと思います。問題があったら実行したらうまくいくかも、ぐらいの考えを頭の片隅に置いておく程度でよいかと思います。