make時にPython.hが認識されない

Question

[問題]
opencvの環境作りのためにcmakeのconfigure後にmakeしようとしたら、errorが出てしまいます。

[環境]
ubuntu 18.04
pyenv上でanaconda3-5.3.1
python3.7
opencv4.0.1とcontrib4.0.1の導入

[手順]

以下のようなオプションでcmakeをconfigureさせました。

(cv) (anaconda3-5.3.1/envs/cv) (base) qcmp@qcmp-Alienware-Aurora-R8:~/opencv/build$ cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=RELEASE -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local -D OPENCV_EXTRA_MODULES_PATH=~/opencv_contrib/modules -D PYTHON3_EXECUTABLE=$CONDA_HOME/envs/cv/bin/python -D PYTHON3_PACKAGES_PATH=$CONDA_HOME/envs/cv/lib/python3.7/site-packages -D BUILD_opencv_python2=OFF -D BUILD_opencv_python3=ON -D INSTALL_PYTHON_EXAMPLES=ON -D INSTALL_C_EXAMPLES=OFF  -D OPENCV_ENABLE_NONFREE=ON -D BUILD_EXAMPLES=ON -D ENABLE_PRECOMPILED_HEADERS=OFF -D BUILD_TESTS=OFF -D PYTHON3_LIBRARY=/home/qcmp/anaconda3/lib/libpython3.7m.so -D PYTHON3_INCLUDE_DIR=/home/qcmp/anaconda3/include/python3.7m -D WITH_CUBLAS=OFF -D OpenBLAS_FOUND=OFF ..

その時の出力は文字数の関係でこちらのリンクに載せます。

その後make -j8をすると、以下のようなエラーが出ます。(一部抜粋)

/home/qcmp/opencv/modules/python/src2/cv2.cpp:9:10: fatal error: Python.h: そのようなファイルやディレクトリはありません
 #include <Python.h>
          ^~~~~~~~~~
compilation terminated.
modules/python3/CMakeFiles/opencv_python3.dir/build.make:62: recipe for target 'modules/python3/CMakeFiles/opencv_python3.dir/__/src2/cv2.cpp.o' failed
make[2]: *** [modules/python3/CMakeFiles/opencv_python3.dir/__/src2/cv2.cpp.o] Error 1
CMakeFiles/Makefile2:12152: recipe for target 'modules/python3/CMakeFiles/opencv_python3.dir/all' failed
make[1]: *** [modules/python3/CMakeFiles/opencv_python3.dir/all] Error 2

Python.hがないということですが、cmake時に-D PYTHON3_LIBRARY=/home/qcmp/anaconda3/lib/libpython3.7m.so -D PYTHON3_INCLUDE_DIR=/home/qcmp/anaconda3/include/python3.7mとパスを設定し、実際にPython.hがhome/qcmp/anaconda3/include/python3.7m/Python.hにあります。

他に直すべきところを教えていただきたいです。

[追記]
cmakeのオプションを以下のように変えてみました。該当ファイルパスを検索しています。

cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=RELEASE -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=$(python -c "import sys; print(sys.prefix)")  -D OPENCV_EXTRA_MODULES_PATH=~/opencv_contrib/modules -D PYTHON3_INCLUDE_DIR=$(python -c "from distutils.sysconfig import get_python_inc; print(get_python_inc())") -D PYTHON3_EXECUTABLE=$(which python) -D PYTHON3_PACKAGES_PATH=$(python -c "from distutils.sysconfig import get_python_lib; print(get_python_lib())") -D PYTHON3_LIBRARY=$(python -c "import distutils.sysconfig as sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('LIBDIR') + '/' + sysconfig.get_config_var('LDLIBRARY'))") -D BUILD_opencv_python2=OFF -D BUILD_opencv_python3=ON -D INSTALL_PYTHON_EXAMPLES=ON -D INSTALL_C_EXAMPLES=OFF  -D OPENCV_ENABLE_NONFREE=ON -D BUILD_EXAMPLES=ON .. 

検索結果は以下のようになっています。

$ which python
/home/qcmp/.pyenv/shims/python
$ python -c "from distutils.sysconfig import get_python_inc; print(get_python_inc())"
/home/qcmp/.pyenv/versions/anaconda3-5.3.1/envs/cv/include/python3.7m
$ python -c "from distutils.sysconfig import get_python_lib; print(get_python_lib())"
/home/qcmp/.pyenv/versions/anaconda3-5.3.1/envs/cv/lib/python3.7/site-packages
$ python -c "import sys; print(sys.prefix)"
/home/qcmp/.pyenv/versions/anaconda3-5.3.1/envs/cv
$ python -c "import distutils.sysconfig as sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('LIBDIR') + '/' + sysconfig.get_config_var('LDLIBRARY'))"
/home/qcmp/.pyenv/versions/anaconda3-5.3.1/envs/cv/lib/libpython3.7m.so

しかし、最初と同じエラーが出ます。

Answer 1

こちら全てインストールからやり直してエラーが消えました

Answer 2

エラーはgccが出しているので、挙げられている環境変数は直接関係ないと思います。

おそらくpython-devとかいう名前のパッケージをapt installすれば解決するのではないでしょうか。

Comments

[shmpwk]

ご回答ありがとうございます。
まず、gccがエラーを出しているというのは、どこで判断ができるか教えていただきたいです。
また、python-devは既に最新のものがインストール済みでした。

[KojiDoi]

エラーメッセージにcppと出ていますので問題はCコンパイラ関係です。ubuntuなのでgccだろうと判断しました。
環境変数で探索ディレクトリを追加指定してやればどうでしょうか。
参考:
https://qiita.com/DQNEO/items/4e5c2eca2761ec08b922

[shmpwk]

すみません、あまりよくわからず調べて返信に時間がかかってしまいましたが、環境変数で探索ディレクトリを追加指定するのはcmakeのオプション-Dで追加するということでしょうか？gccのオプション -Iをやるということでしょうか？
前者はもともとやっているので、後者を試してみましたが、ファイルがみつからないと出ました。
```
$ gcc -I /home/qcmp/.pyenv/versions/anaconda3-5.3.1/envs/cv/include/python3.7m Python.h
gcc: error: Python.h: そのようなファイルやディレクトリはありません
gcc: fatal error: no input files
```
パスはあっていると思うのですが、、、

[shmpwk]

python3.7m下にPython.cを作ってPython.hをincludeしてみましたが、ダメでした。

```
~$ gcc -I /home/qcmp/.pyenv/versions/anaconda3-5.3.1/envs/cv/include/python3.7m Python.c
gcc: error: Python.c: そのようなファイルやディレクトリはありません
gcc: fatal error: no input files
compilation terminated.
```