質問をすることでしか得られない、回答やアドバイスがある。

15分調べてもわからないことは、質問しよう!

ただいまの
回答率

87.35%

R studioでread.transactions(file)の読み込みエラー

解決済

回答 1

投稿

  • 評価
  • クリップ 0
  • VIEW 2,036

score 5

前提・実現したいこと

R studioでlibrary(arules)を使ってアソシエーション分析を行おうとしています。
コンマ区切りのデータ(x.txt)を読み込みたいのですがエラーが発生してしまいます。
また、警告メッセージについても何が起きているか分かりませんでした。

x.txtのデータの上から3行は以下のイメージです。(データが公開出来ないものなので)
実際のデータではアルファベットに、日本語の無数にある固有名詞が入ります。
行数は約30万行あります。
1行を1transactionとして考えています。
各行には重複の要素がありますが削除せず別々の要素として読み込ませたいです。
各行の要素数は不定です。(要素数>1)

--- x.txt ---

A,B,C,A
D,E,A
F,G,H,I

発生している問題・エラーメッセージ

validObject(.Object) でエラー: 
invalid class “ngCMatrix” object: row indices are not sorted within columns
追加情報:  警告メッセージ: 
scan(text = l, what = "character", sep = sep, quote = quote,  で: 
クオートで囲まれた文字列中にEOFがあります 

該当のソースコード

y <- read.transactions(file='x.txt',sep=',',format='basket',rm.duplicate=T)

R言語

試したこと

x.txtの行数を数千程度にしたところエラーが発生せずに読み込まれました。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

RStudio
Version 1.2.1335

  • 気になる質問をクリップする

    クリップした質問は、後からいつでもマイページで確認できます。

    またクリップした質問に回答があった際、通知やメールを受け取ることができます。

    クリップを取り消します

  • 良い質問の評価を上げる

    以下のような質問は評価を上げましょう

    • 質問内容が明確
    • 自分も答えを知りたい
    • 質問者以外のユーザにも役立つ

    評価が高い質問は、TOPページの「注目」タブのフィードに表示されやすくなります。

    質問の評価を上げたことを取り消します

  • 評価を下げられる数の上限に達しました

    評価を下げることができません

    • 1日5回まで評価を下げられます
    • 1日に1ユーザに対して2回まで評価を下げられます

    質問の評価を下げる

    teratailでは下記のような質問を「具体的に困っていることがない質問」、「サイトポリシーに違反する質問」と定義し、推奨していません。

    • プログラミングに関係のない質問
    • やってほしいことだけを記載した丸投げの質問
    • 問題・課題が含まれていない質問
    • 意図的に内容が抹消された質問
    • 過去に投稿した質問と同じ内容の質問
    • 広告と受け取られるような投稿

    評価が下がると、TOPページの「アクティブ」「注目」タブのフィードに表示されにくくなります。

    質問の評価を下げたことを取り消します

    この機能は開放されていません

    評価を下げる条件を満たしてません

    評価を下げる理由を選択してください

    詳細な説明はこちら

    上記に当てはまらず、質問内容が明確になっていない質問には「情報の追加・修正依頼」機能からコメントをしてください。

    質問の評価を下げる機能の利用条件

    この機能を利用するためには、以下の事項を行う必要があります。

回答 1

checkベストアンサー

+1

おそらく、引用符を含みかつその引用符に対応する「閉じるほうの引用符」が欠落している行があるのではないでしょうか。入力ファイルを適当に分割して入力し、どの行で問題が発生するのかを確かめてみてください。

投稿

  • 回答の評価を上げる

    以下のような回答は評価を上げましょう

    • 正しい回答
    • わかりやすい回答
    • ためになる回答

    評価が高い回答ほどページの上位に表示されます。

  • 回答の評価を下げる

    下記のような回答は推奨されていません。

    • 間違っている回答
    • 質問の回答になっていない投稿
    • スパムや攻撃的な表現を用いた投稿

    評価を下げる際はその理由を明確に伝え、適切な回答に修正してもらいましょう。

  • 2019/09/22 19:21

    そちらのQ&Aではlist型をtransaction型に変える時の場合で、 変える前にdata<-lapply(data,sort)の処理をしてあげる事でエラーが回避されるみたいですね。今回の場合、.txtをそのままtransacition型として読み込みたいので適用が難しそうでした。
    x.textをx.csvとしてread.csv()をすると読み込みは可能なのですが列数が異なるため、
    A,B,C,A
    D,E,A,
    F, , ,
    のように最大の列数に合わせるように空の要素も読み込まれてしまいます。
    なのでread.transaction()を使いたいということになります。

    キャンセル

  • 2019/09/23 00:03

    列数が一定でないことだけが問題なら、
    sapply( readLines("x.txt"), function(x){strsplit(x, ",")})
    のようにすれば各行のデータを内容とするリストが得られると思いますが、これではダメなんでしょうか。

    キャンセル

  • 2019/09/23 01:12

    教えて頂いたコードでリストを作り、先ほどのQ&Aの処理を実行しましたが同じエラーがでてしまいました。
    しかし最初の方法で、エラーがある行を全部削除し実行したところ、無事に読み込むことが出来ました。
    エラーの行は2行有り、
    A,A,A,A
    B,B,B
    のように同じ要素のみで成る行でした。同様の行でエラーを出さない行もあるので原因は分かりませんでした。
    ですが、読み込みが可能となったので解決と致します。
    親切に何度も御回答して頂きありがとうございました。

    キャンセル

15分調べてもわからないことは、teratailで質問しよう!

  • ただいまの回答率 87.35%
  • 質問をまとめることで、思考を整理して素早く解決
  • テンプレート機能で、簡単に質問をまとめられる

関連した質問

同じタグがついた質問を見る