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ここに質問を書いてください。

DDBJのFAQページ
公開されているデータをダウンロードする方法を教えてください。wget コマンドを使って ftp サーバからデータを簡単に取得することができます。
に従って、
ここに書いてあるコマンド
wget ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/dra/fastq/DRA000/DRA000001/DRX000001/DRR000001.fastq.bz2
をターミナルにコピペして実行してみましたがタイムアウトになってしまいます。

発生している問題・エラーメッセージ

ターミナルの画面は下記のようになります。

ターミナル画面1

ターミナル画面2

(base) h82:~ jojo2$ wget ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/dra/fastq/DRA000/DRA000001/DRX000001/DRR000001.fastq.bz2
--2019-08-11 13:20:38--  ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/dra/fastq/DRA000/DRA000001/DRX000001/DRR000001.fastq.bz2
=> ‘DRR000001.fastq.bz2’
Resolving ftp.ddbj.nig.ac.jp... 133.39.24.50
Connecting to ftp.ddbj.nig.ac.jp|133.39.24.50|:21... failed: Operation timed out.
Retrying.

....

--2019-08-11 13:30:43--  ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/dra/fastq/DRA000/DRA000001/DRX000001/DRR000001.fastq.bz2
(try:20) => ‘DRR000001.fastq.bz2’
Connecting to ftp.ddbj.nig.ac.jp|133.39.24.50|:21... failed: Operation timed out.
Giving up.

試したこと

・セキュリティソフトとファイアウォールをoff
・illuminaのサイトから同様の手順で実施すると、Homo sapiens、HCBI、build37.2はダウンロード出来ました。
・その他のサイト(例えばArray Express)からのダウンロードはやはりタイムアウトになります。
・大学からアクセスしています。管理者に確認したところ、先方のサイトまでは行けていて、最後ファイルに
アクセスするところがうまくいっていないそうです。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

MacBook Pro(macOS Mojave ver.10.14.6)

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  • 退会済みユーザー

    退会済みユーザー

    2019/08/11 15:58

    わかりました。すみません。あと、ターミナルのスクリーンショットを載せてもらえますか❓
    なんどもすみません。

    キャンセル

  • jojo2

    2019/08/11 16:43

    コメントありがとうございます。スクリーンショットを追加いたしました。こちらがお手数をおかけしております。申し訳ありません。修正点がありましたらまたご指摘いただけますとたいへん助かります。不慣れですが今後ともどうぞよろしくお願いいたします。

    キャンセル

  • 退会済みユーザー

    退会済みユーザー

    2019/08/11 16:45

    いえ私も言葉遣いを気をつけるようにします。(^^)すみません。

    キャンセル

回答 2

checkベストアンサー

0

すみません。一回こちらから失礼します。
wgetでこういう時はこうする!!
こちらのサイトはどうでしょうか?(お役に立てたら嬉しいですが・・)
もし、いやいやこれ違うよ!ということであればまたお知らせください。お手数おかけします。m(_ _)m

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  • 2019/08/11 16:01

    jojo2さんは今日始めたのですね。すみません、きつい言い方をしてしまって。

    キャンセル

  • 2019/08/11 19:18

    いえいえ全然問題ありません。こういう専門家のサイトでは誰も返信してくれないだろうなと予想していましたので、コメントをいただいてたいへんありがたいです。リンクもありがとうございました。とても参考になります。
    あれから調べて、DDBJのサイトに「FTP接続ができません 作成日: 2014年5月30日」というのがありまして、MACの場合はCyberduckというのを使うのかもしれません。この辺でもう少しやってみようと思います。ありがとうございました。今後もお気づきの点がありましたらまた教えてください。よろしくお願いいたします。(m- -m)

    キャンセル

  • 2019/08/25 18:03

    わかりました!!(^^)

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