案1.Firewallでフィルタリングする。
WEBサーバより前のロードバランサ等で、IPアドレス等によるフィルタリングを行い、APIサーバに通信が到達しないようにする。
案2.api.example.comのドメインに対し、CNAMEでsafsfdakjhsfadjfals.example.comのような値を登録しておき、そのドメインに対するIP解決を公開しない(ローカルPCのhostsファイル等で解決させる)
案3.1と2の合わせ技
基本として、robots.txtの設置等は済ませておくこと。