python3 for loop内で動かす自作関数の計算時間が長すぎたときにスキップしたい

Question

scipy.linalg.eighの計算時間次第でloopを1回スキップするということは可能でしょうか？

pythonにて自作関数内でscipy.linalg.eighを用いて対象行列の固有値分解を行っています．

この処理をfor loopにて回しているのですが，その中で稀に計算時間が恐ろしく長いものが出てきます．

cpuの稼働率を見ると，通常時は全コア稼働しているのですが
計算が終わらないものでは1つのコアでしか動いていないようでした．

そこで，このように計算が収束しない（？）ものについてはloopをスキップしたく思います．

どうぞよろしくお願いいたします．

Answer 1

scipy.linalg.eighを実行中に処理を強制終了させたいということでしょうか。
自分で作成した関数で強制的に終了させるのでなければ、長くかかりそうな処理を
別のスレッドかプロセスにして、条件により当該スレッドなりプロセスを強制終了する
という形になるのではないでしょうか。

Comments

[Renkon]

＞自分で作成した関数で強制的に終了させる
この判定をscipy.linalg.eighの実行時間で決めたいです．

[t_obara]

「自分で作成した関数」の意味は、scipy.linalg.eigh自体をご自身で作成するということです。scipy.linalg.eighを弄れないのであれば、scipy.linalg.eighの実行をスレッドやプロセスを別にして実行させた上で、タイマーなりで時間を監視し、それを超えたら当該スレッドやプロセスを強制終了するしかないかと。

Answer 2

・その関数の開始／終了時刻を取得して計算時間を算出
・次のループ時にその計算時間がながければ実行をスキップ

で、どれがわからないのでしょうか

Comments

[Renkon]

scipy.linalg.eighを計算が終了しない間に，
その計算時間次第で実行をスキップするというのがわかりません．

[y_waiwai]

計算時間が長ければ次のループをスキップという話ではないんですか？

[Renkon]

loop内で固有値分解をします．

なので，計算時間の長いloopをスキップしたいです．

[y_waiwai]

関数を終了させると言うなら、そういう処理を書く必要があります
そのscipy.linalg.eighという関数を改造する必要がありますね

[Renkon]

やはりそうなりますか．
なかなかハードそうですね．
ありがとうございます．