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決定木の可視化について

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py_beginner

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pythonでsklearnを使用し決定木を試しているのですが、「InvocationException: GraphViz's executables not found」というエラーが出てきます。
このエラーの解消方法をご教示頂けますでしょうか。
宜しくお願いします。

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.tree import export_graphviz
import pydotplus
from sklearn.externals.six import StringIO


iris = load_iris()
X = iris.data[:,2:]
Y = iris.target

tree_clf = DecisionTreeClassifier(max_depth=2)
tree_clf.fit(X,Y)


export_graphviz(
    tree_clf,
#     out_file=image_path("iris_tree.dot"),
    out_file="iris_tree.dot",
    feature_names=iris.feature_names[2:],
    class_names=iris.target_names,
    rounded=True,
    filled=True
)

# # 作成した決定木を可視化 (pydotplus パッケージを利用)
dot_data = StringIO()
export_graphviz(tree_clf, out_file=dot_data)
graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())

# # PDFファイルに出力
graph.write_pdf("graph.pdf")

from IPython.display import Image
Image(graph.create_png())
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回答 1

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graphvizというのはpythonとは無関係の外部のツールでして、pydotplusといったpythonライブラリはそのwrapperに過ぎません。

なので、まずはgraphvizをインストールしてください。OSによって手順は異なります。

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  • 2018/11/18 15:01

    早速ありがとうございます。
    インストールとは下記でよろしいでしょうか。
    from graphviz import Digraph

    すみませんこちら質問にソースを転記する際漏れておりました。こちらmacのターミナルからpip install でインストールし使用しているのですが、それでも質問内容のエラーが生じている状況です。

    キャンセル

  • 2018/11/18 15:03 編集

    from graphviz import Digraph
    はインストールではありませんし、pipによるいかなる操作もgraphviz本体のインストールではありません。
    macなら「brew install graphviz」でgraphviz本体のインストールが行えるかと。
    https://qiita.com/umasoya/items/c1c4e583f393b27ebb7a

    キャンセル

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