singularityのインストール

SingularityをCentOS7にインストールしています。

http://singularity.lbl.gov/quickstart の　Installationにしたがって

$ git clone https://github.com/singularityware/singularity.git 
$ singularity

と実行しましたが、その次に実行しろと書かれているautogen.shがありません。

INSTALL.mdには下記の説明がありました。

$ cd $GOPATH/src/github.com/sylabs/singularity
$ ./mconfig
$ cd ./builddir
$ make
$ sudo make install

$ ./mconfigを実行すると最後に下記が表示されます。

=> builddir/Makefile ready, try:
   $ cd builddir
   $ make

makeを実行すると下記のエラーになってしまいます。

$ make
find: '/home/hoge/singularity/cmd/startergithub.com/sylabs/singularity/internal/app/starter': No such file or directory
find: '/home/hoge/singularity/cmd/startergithub.com/sylabs/singularity/internal/pkg/runtime/engines/config/starter': No such file or directory

"There are many ways to install Singularity but this quick start guide will only cover one."とあるので、この通りにやればできると考えたのですが、
うまくできた方がいらしたらどこで間違ってしまったか、教えてください。

https://singularity.lbl.gov/install-linux にある下記の方法ではインストールできました。

$ VERSION=2.5.2
$ wget https://github.com/singularityware/singularity/releases/download/$VERSION/singularity-$VERSION.tar.gz
$ tar xvf singularity-$VERSION.tar.gz
$ cd singularity-$VERSION
$ ./configure --prefix=/usr/local
$ make
$ sudo make install

$ singularity --version
2.5.2-dist

行動規範の内容に同意します

回答2件

ベストアンサー

autogen.shを使用してのインストールは2.6.0までみたいですね。
3.0.0からはドキュメントのURLも変わって、インストール方法も変更されているようです。
2.6.0のインストール
 3.0系のインストール

投稿2018/11/16 08:15

退会済みユーザー

総合スコア0

taro373

2019/06/10 02:19

V2がインストールできていたので、そのままにしていましたがあらためて公式マニュアルに書かれてある方法でインストールを行い V3がインストールできました。 $ singularity --version singularity version 3.2.1-627.gfae3307 過去の作業記録を見ると公式ページの「Finally, set up your environment for Go」の部分の操作が抜けていたかもしれません。またGO言語が>=1.11.1である必要もありました。

行動規範の内容に同意します

以下通りにやれば問題なくmakeできました。

https://github.com/sylabs/singularity/blob/master/INSTALL.md

実際に実行したコマンド

sudo yum groupinstall -y 'Development Tools'
sudo yum install -y openssl-devel libuuid-devel libseccomp-devel
export VERSION=1.11 OS=linux ARCH=amd64
cd /tmp
sudo yum -y install wget
wget https://dl.google.com/go/go$VERSION.$OS-$ARCH.tar.gz
sudo tar -C /usr/local -xzf go$VERSION.$OS-$ARCH.tar.gz
echo 'export GOPATH=${HOME}/go' >> ~/.bashrc
echo 'export PATH=/usr/local/go/bin:${PATH}:${GOPATH}/bin' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
mkdir -p $GOPATH/src/github.com/sylabs
cd $GOPATH/src/github.com/sylabs
git clone https://github.com/sylabs/singularity.git
cd singularity
./mconfig
cd ./builddir
make

投稿2018/11/16 08:03