JpaRepositoryメソッドが呼べない

前提・実現したいこと

SpringBootにおいて、JpaRepositoryを継承しているRepositoryインタフェースを用意し、JpaRepository で定義されている deleteByIdを呼び出すとエラーが発生します(overrideすれば正常に実行できます)。
JpaRepositoryクラスで実装されているはずのdeleteByIdをそのまま使用できない理由は何でしょうか。

Serviceクラス

  @Transactional
  public void delete(int id) {
    repository.deleteById(id);
  }

Repositoryインタフェース(Repositoryに以下を記載すると正常に実行されます。)

  @Modifying
  @Query(value = "DELETE AAA WHERE RECORD_ID = :id", nativeQuery = true)
  void deleteById(@Param("id") int id);

Repositoryインタフェースで利用しているEntityクラス

@Entity
@Table(name = "AAA")
@NoArgsConstructor
@AllArgsConstructor
@Data
public class BBB extends TransactionEntity implements Serializable {

  /**
   * Serial Version UID : 1
   */
  private static final long serialVersionUID = 1L;
  @Id
  @Column(name = "CCC")
  private Integer ccc;
  @Id
  @Column(name = "RECORD_ID")
  private Integer recordId;

  @ManyToOne
  @JoinColumn(name = "RECORD_ID")
  private BBB bbb;

  @ManyToOne
  @JoinColumn(name = "CCC")
  private DDD ddd;
}

■■API実行時に以下のエラーメッセージが発生しました。
JpaRepositoryインタフェースで実装されているデフォルトのdeleteByIdをそのまま使用した際(新しくdeleteByIdを作成しなかった際)。

発生している問題・エラーメッセージ

{
    "timestamp": "2018-11-15T13:28:14.296+0000",
    "status": 500,
    "error": "Internal Server Error",
    "message": "org.springframework.dao.InvalidDataAccessResourceUsageException: could not execute statement; SQL [n/a]; nested exception is org.hibernate.exception.SQLGrammarException: could not execute statement",
    "path": "/api/v2/records/19",
}