前提・実現したいこと
R ver.3.5.1でCitrusパッケージを導入する
OSはmacOS High Sierra 10.13.6です
発生している問題・エラーメッセージ
clang: error: unsupported option '-fopenmp' make: *** [hclust.o] Error 1 ERROR: compilation failed for package ‘Rclusterpp’
該当のソースコード
R
1install_github("nolanlab/Rclusterpp")
試したこと
サイトで推奨されているR ver.3.0.3でインストールを試みましたが、Rがうまく動きません
補足情報(FW/ツールのバージョンなど)
R ver.3.5.1で下記のサイトに従ってCitrusパッケージをインストールしています。
https://github.com/nolanlab/citrus/wiki/Installing-Citrus
R>install_github("nolanlab/Rclusterpp”)と入力すると下記メッセージが表示され、うまくインストールできません。
サイトではR ver.3.0.3でインストールを勧められていますが、うまくインストールできません。
Rの初心者で基本的な質問で申し訳ございませんが、ご回答よろしくお願いします。
install_github("nolanlab/Rclusterpp")
Downloading GitHub repo nolanlab/Rclusterpp@master
checking DESCRIPTION meta-information ...k/x2dw6ff1507d0276x7fxkm6w0000gn/T/RtmpEto6yB/remotes6ca850d1d2e3/nolanlab-Rclusterpp-740cb0b/DESCRIPTION’ ...
- installing source package ‘Rclusterpp’ ...
** libs
clang++ -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG -I"/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/Rcpp/include" -I"/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/RcppEigen/include" -I/usr/local/include -I../inst/include -fopenmp -fPIC -Wall -g -O2 -c hclust.cpp -o hclust.o
clang: error: unsupported option '-fopenmp'
make: *** [hclust.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘Rclusterpp’
- removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/Rclusterpp’
i.p(...) でエラー:
(警告から変換されました) installation of package ‘/var/folders/sk/x2dw6ff1507d0276x7fxkm6w0000gn/T//RtmpEto6yB/file6ca884031ce/Rclusterpp_0.2.4.tar.gz’ had non-zero exit status