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pyenvで作成した環境でjupyterを操作できない

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 pyenvでインストールしたjupyterを起動したい

pyenvで構築したpython環境が崩れてしまいました、、、
OS はmacOS sierraです。
一週間くらい前までは問題なかったのですが、気づいたらおかしなことになってしまいました。
jupyter自体は起動できるものの、systemのpython環境での操作しかできなくなってます。
現状下記のような状態で作業しています。

$ pyenv versions
  system
  anaconda2-5.1.0
* anaconda3-4.0.0 


通常であればpyenvで設定している環境でjupyterを開くはずなのですが
なぜか下記のようになっていて思ったような作業ができません(python2しか使えない)。

$ which python
/Users/name/.pyenv/shims/python
$ which jupyter
/usr/local/bin/jupyter

下記のようになるのが正しいようです。

$ which jupyter
/Users/name/.pyenv/shims/jupyter

どのようにしたら、pyenv内のjupyterを実行することができるでしょうか?

 発生している問題・エラーメッセージ

jupyter はpython2の状態で実行できるものの下記のようなメッセージが最初に出てきます。

kCFURLVolumeIsAutomountedKey missing for file:///private/var/folders/zz/zyxvpxvq6csfxvn_n0000000000000/T/FPInstallMountPoint/: Error Domain=NSCocoaErrorDomain Code=257 "ファイル“FPInstallMountPoint”を表示するためのアクセス権がないため、開けませんでした。" UserInfo={NSURL=file:///private/var/folders/zz/zyxvpxvq6csfxvn_n0000000000000/T/FPInstallMountPoint/, NSFilePath=/private/var/folders/zz/zyxvpxvq6csfxvn_n0000000000000/T/FPInstallMountPoint, NSUnderlyingError=0x7f9e2f644a20 {Error Domain=NSPOSIXErrorDomain Code=13 "Permission denied"}}

 試したこと

pyenvのPATHの設定は通す順番などにも注意して適切にしたつもりです。
おかしくなる前に行ったことの中で関係がありそうなものは、https://hdfeos.org/software/pyhdf.php
によるpyhdfの設定ですが、関係があるかはよくわかりません。

$ /Users/name/.pyenv/shims/jupyter notebook 


のようにjupyterを起動してみても同じ結果になりました。

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  • t_obara

    2018/08/23 11:37

    OSはmacでしょうか?XCodeを入れてから再起動していないとか?

    キャンセル

  • fushiming

    2018/08/23 12:35

    ご質問ありがとうございます!macOS Sierraです。Xcodeは2年ぐらい前のpc購入時にインストールしてからそのままです。pcは再起動してみましたが、変化ありませんでした、、、

    キャンセル

回答 3

check解決した方法

0

下記のURLを試すと解決しました。
https://qiita.com/shierote/items/421af3c741c0f9956b09

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jupyterを動かすのは、カーネル選択さえできれば、どのPythonでもいいと思います

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  • 2018/08/23 12:39

    ご回答ありがとうございます!カーネル選択の設定方法を調べてみて試してみます!pipでインストールできないモジュールを色々と設定しているので、pyenvで作ったpython環境でjupyterを操作できると嬉しいなと思っています。

    キャンセル

0

下記でpython3を追加できました
https://qiita.com/shierote/items/421af3c741c0f9956b09
モジュールを反映させるには下記が役立ちました。
https://qiita.com/Gattaca/items/80a5d36673ba2b6ef7f0

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