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R でas.data.frameを使うとデータフレームが転置されてしまう

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R で データフレームにapplyをかけて, ggplotように変形させようとしたのですが, オブジェクトの型と形状で問題が発生しました.

やりたいこととしては, あるデータフレームに対してapply()を使ってその結果をggplotでプロットすることになります.
ggplotに入力するオブジェクトdf2はdf1から次のプロセスで得るものとします.

df1 %>% gather(key = variable, value = value) -> df2


最終的に目的のものは得られていますが,対処療法でしかないので, 転置を回避する方法を教えてください.

問題1. apply()を使うと型がデータフレームではなくなる

>head(iris)
  Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
3          4.7         3.2          1.3         0.2  setosa
4          4.6         3.1          1.5         0.2  setosa
5          5.0         3.6          1.4         0.2  setosa
6          5.4         3.9          1.7         0.4  setosa
>apply(iris[,1:4],2,mean)
Sepal.Length  Sepal.Width Petal.Length  Petal.Width 
    5.843333     3.057333     3.758000     1.199333 
>class(apply(iris[,1:4],2,mean))
[1] "numeric"


といったように, apply()の計算結果がnumaricの型になってしまいます

問題2. as.data.frame() で変形すると転置される

じゃあ, データフレームに変換すればいいじゃないかと, as.data.frame()を使うと, なぜか転置されます.

>as.data.frame(apply(iris[,1:4],2,mean))
             apply(iris[, 1:4], 2, mean)
Sepal.Length                    5.843333
Sepal.Width                     3.057333
Petal.Length                    3.758000
Petal.Width                     1.199333


ならば, 再度転置すればいいじゃないか,ということでt()を使うと型が変わります.

>t(as.data.frame(apply(iris[,1:4],2,mean)))
                            Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
apply(iris[, 1:4], 2, mean)     5.843333    3.057333        3.758    1.199333
> class(t(as.data.frame(apply(iris[,1:4],2,mean))))
[1] "matrix"


ちなみにtranspose()だと名前が変わります.

>transpose(as.data.frame(apply(iris[,1:4],2,mean)))
        V1       V2    V3       V4
1 5.843333 3.057333 3.758 1.199333


さらに, 転置したものをas.data.frame()で変換すると,今度は転置されずにようやく目的のものが得られます.

> as.data.frame(t(as.data.frame(apply(iris[,1:4],2,mean))))
                            Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
apply(iris[, 1:4], 2, mean)     5.843333    3.057333        3.758    1.199333
> class(as.data.frame(t(as.data.frame(apply(iris[,1:4],2,mean)))))
[1] "data.frame"
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