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カラム数が不揃いなcsvを取り込みたい

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takada0305

score 3

 前提・実現したいこと

以下のような、カラム数が行によって異なるcsvがあります。
これをデータベース上のテーブルに取り込みたいです。

1,3,aaa,bbb,ccc
2,2,ddd,eee


できれば、事前にcsv側を加工することなく取り込みたいのですが、難しいでしょうか。

 試したこと

不足分はNULLになってくれることを期待して、
カラム数多めのテーブルを用意し、copy実行しましたがそうはならないようでした。
またそのようなオプションを見つけることができませんでした。

CREATE TABLE test3 (id int, length int, col1 text, col2 text, col3 text);
COPY test3 FROM '/data.csv' WITH CSV;
ERROR:  列"col3"のデータがありません
CONTEXT:  test3のCOPY。行番号 2: "2,2,ddd,eee"

 補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

PostgreSQL 9.5.12

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回答 2

checkベストアンサー

+2

CSVとはせず、textで1行1項目として取り込んだ後に、加工するのはどうでしょうか。

一旦仮テーブルに取り込んで置いて、その後配列として分解して本来のテーブルに挿入。

CREATE TABLE test3 (id int, length int, col1 text, col2 text, col3 text);
CREATE temp TABLE test (item text) on commit drop;
COPY test FROM '/data.csv' WITH text;
insert into test3 
select string_to_array(item ,','))[1]::int -- id
     , string_to_array(item ,','))[2]::int -- length
     , string_to_array(item ,','))[3]      -- col1
     , string_to_array(item ,','))[4]      -- col2
     , string_to_array(item ,','))[5]      -- col3
from test
--※添え字に該当するものが無い場合はNullになる

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  • 2018/03/05 22:48

    上手な方法を見落としているんじゃないかと継続して調べていましたが、
    おかげさまで、やはり何らか加工するしかなさそうだと、諦めがつきました。
    具体的な加工の仕方も参考になりました。
    ありがとうございます。

    キャンセル

0

足りないカンマを足すだけでは?

$ cat data.csv|awk -F, -vn=5 '{for(i=1;i<=NF;i++){printf$i","};for(;i<=n;i++){printf","};print""}'|sed 's/,$//'
1,3,aaa,bbb,ccc
2,2,ddd,eee,

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  • 2018/03/05 22:54

    そうですね。
    できれば、事前にcsv側を加工することなく取り込む方法はないものかと考えていましたが、
    難しそうなので、csv側を加工するか、
    もう一方の回答のように、DBに入れた後加工するか考えてみます。

    キャンセル

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