多次元配列を使って作ったチャートを元に計算するプログラムが完成できず困っている

学校のJAVAのクラスの課題のプログラムを作っているのですがうまくいきません。
多次元配列を使ったプログラムを書いています。
私のプログラムを直していただけませんか？

＜課題＞
このチャートを元にユーザーにアルファベットを入力してもらいます。ユーザーが−１を入力するまでインプットをしてもらい続けます。

サンプルがこれです。ユーザーがもしACKRFYYAとCRRFYを入力したとします。すると、二つ目のストリングのほうが１つ目よりも短いのでそれを補うために２つ目のストリングの初めに＊を表示させます。もしも２文字以上短い場合は１つ目以降の＊はストリングの語尾に足します。
そしてチャートと二つのストリングを元になんの数字になるのか表示させます。そして最後に全ての数字を足した答えもプリントします。

＜自分の書いたコード＞

java
1import java.util.Scanner;
2public class ProteinScore {
3	public static void main(String[] args){
4		
5		Scanner sc = new Scanner(System.in);
6		
7		String alp = "ARNDCQEGHILKMFPSTWYV*";
8		String input;
9		
10		int[][] protein = {
11				{4,-1,-2,-2,0,-1,-1,0,-2,-1,-1,-1,-1,-2,-1,1,0,-3,-2,0,-4},
12				{-1,5,0,-2,-3,1,0,-2,0,-3,-2,2,-1,-3,-2,-1,-1,-3,-2,-3,-4},
13				{-2,0,6,1,-3,0,0,0,1,-3,-3,0,-2,-3,-2,1,0,-4,-2,-3,-4},
14				{-2,-2,1,6,-3,0,2,-1,-1,-3,-4,-1,-3,-3,-1,0,-1,-4,-3,-3,-4},
15				{0,-3,-3,6,-3,0,2,-1,-1,-3,-4,-1,-3,-3,-1,0,-1,-4,-3,-3,-4},
16				{-1,1,0,0,-3,5,2,-2,0,-3,-2,1,0,-3,-1,0,-1,-2,-1,-2,-4},
17				{-1,0,0,2,-4,2,5,-2,0,-3,-3,1,-2,-3,-1,0,-1,-3,-2,-2,-4},
18				{0,-2,0,-1,-3,-2,-2,6,-2,-4,-4,-2,-3,-3,-2,0,-2,-2,-3,-3,-4},
19				{-2,0,1,-1,-3,0,0,-2,8,-3,-3,-1,-2,-1,-2,-1,-2,-2,2,-3,-4},
20				{-1,-3,-3,-3,-1,-3,-3,-4,-3,4,2,-3,1,0,-3,-2,-1,-3,-1,3,-4},
21				{-1,-2,-3,-4,-1,-2,-3,-4,-3,2,4,-2,2,0,-3,-2,-1,-2,-1,1,-4},
22				{-1,2,0,-1,-3,1,1,-2,-1,-3,-2,5,-1,-3,-1,0,-1,-3,-2,-2,-4},
23				{-1,-1,-2,-3,-1,0,-2,-3,-2,1,2,-1,5,0,-2,-1,-1,-1,-1,1,-4},
24				{-2,-3,-3,-3,-2,-3,-3,-3,-1,0,0,-3,0,6,-4,-2,-2,1,3,-1,-4},
25				{-1,-2,-2,-1,-3,-1,-1,-2,-2,-3,-3,-1,-2,-4,7,-1,-1,-4,-3,-2,-4},
26				{1,-1,1,0,-1,0,0,0,-1,-2,-2,0,-1,-2,-1,4,1,-3,-2,-2,-4},
27				{0,-1,0,-1,-1,-1,-1,-2,-2,-1,-1,-1,-1,-2,-1,1,5,-2,-2,0,-4},
28				{-3,-3,-4,-4,-2,-2,-3,-2,-2,-3,-2,-3,-1,1,-4,-3,-2,11,2,-3,-4},
29				{-2,-2,-2,-3,-2,-1,-2,-3,2,-1,-1,-2,-1,3,-3,-2,-2,2,7,-1,-4},
30				{0,-3,-3,-3,-1,-2,-2,-3,-3,3,1,-2,1,-1,-2,-2,0,-3,-1,4,-4},
31				{-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,-4,1},
32				};
33		
34		System.out.println("This program will score protein sequences.");
35		System.out.print("Please enter a protein sequence. \nIf you finish entering, please type -1.\n>");
36		input = sc.nextLine();
37		input.toUpperCase();
38		
39		System.out.println(input);
40		
41		
42		while(!input.equals("-1")){
43			System.out.print("Please enter a protein sequence. \nIf you finish entering, please type -1.\n>");
44			input = sc.nextLine();
45			input.toUpperCase();
46			
47			for(int i=0;i<alp.length();i++){
48				for(int j=0;j<alp.length();j++){
49					if(input.charAt(i)==alp.charAt(j))
50						System.out.print(input.charAt(i));
51					else if(input.equals("-1"))
52						return;
53					
54				}
55			}
56			System.out.println();
57		}
58		
59		validate(input,alp);
60		searchIndex(alp,input,protein);
61	}
62		
63	public static boolean validate(String input,String alp){
64		
65		boolean flag = true;
66		int j=0;
67		
68			if(input.equals("-1"))
69				flag = false;
70			
71			while(flag==true){
72				for(int i=0;i<alp.length();i++){
73					if(input.charAt(j)==alp.charAt(i)){
74						
75					}
76					else{
77						System.out.println("Invalid input.");
78					}
79				}
80				j++;
81			}
82				return flag;
83				
84				if(flag==true){
85					printInput(input,flag);
86				}
87		}
88		
89	public static int searchIndex(String alp,String input,int[][] protein){
90		
91		int indOfInput;
92		int count=0;
93		while(count<input.length()){
94			for(int i=0;i<alp.length();i++){
95				if(input.charAt(0)==alp.charAt(i))
96					indOfInput=i;
97			}
98			count++;
99		}
100		
101		calculate(indOfInput,protein);
102	}
103	
104	public static void printInput(String input,boolean flag){
105		
106		if(flag==true){
107			System.out.println(input.toUpperCase());
108		}
109		}
110	
111	public static int calculate(int indOfInput,int[][] protein){
112		
113	}
114	
115
116	}
117
118

＜問題＞
全くのプログラミング初心者なのですが、先生は課題に関する質問には一切答えてくださりませんし、習ったことしか使ってはいけないという規則を設けられているためGoogleで検索しても助けになるページが見つからず、教科書も助けにならず困っています。
すでに１週間以上このプログラムに取り組んでいますがいまだに完成させられません。
どうか助けてもらえないですか？

今まで習ったことは
多次元配列、インデックス、ストリング、charAtなどです。主に自分が書いたコードに使われている文が使用可能なコードとなっています。

よろしく御願いいたします(>_<)

行動規範の内容に同意します

回答1件

ベストアンサー

先生が教えてくれないって言うことを信じて
(配列のデータが表とは違うのでサンプルで間違ってたCCのところだけは直した)

参考程度にどうぞ

Java
1import java.util.Scanner;
2import java.util.ArrayList;
3public class ProteinScore {
4	public static void main(String[] args) {
5		Scanner sc = new Scanner(System.in);
6
7		String alp = "ARNDCQEGHILKMFPSTWYV*";
8		String input = "";
9		ArrayList<String> list = new ArrayList<String>();
10
11		int[][] protein = {
12			{  4, -1, -2, -2,  0, -1, -1,  0, -2, -1, -1, -1, -1, -2, -1,  1,  0, -3, -2,  0, -4},  
13			{ -1,  5,  0, -2, -3,  1,  0, -2,  0, -3, -2,  2, -1, -3, -2, -1, -1, -3, -2, -3, -4},  
14			{ -2,  0,  6,  1, -3,  0,  0,  0,  1, -3, -3,  0, -2, -3, -2,  1,  0, -4, -2, -3, -4},  
15			{ -2, -2,  1,  6, -3,  0,  2, -1, -1, -3, -4, -1, -3, -3, -1,  0, -1, -4, -3, -3, -4},  
16			{  0, -3, -3,  6,  9,  0,  2, -1, -1, -3, -4, -1, -3, -3, -1,  0, -1, -4, -3, -3, -4},  
17			{ -1,  1,  0,  0, -3,  5,  2, -2,  0, -3, -2,  1,  0, -3, -1,  0, -1, -2, -1, -2, -4},  
18			{ -1,  0,  0,  2, -4,  2,  5, -2,  0, -3, -3,  1, -2, -3, -1,  0, -1, -3, -2, -2, -4},  
19			{  0, -2,  0, -1, -3, -2, -2,  6, -2, -4, -4, -2, -3, -3, -2,  0, -2, -2, -3, -3, -4},  
20			{ -2,  0,  1, -1, -3,  0,  0, -2,  8, -3, -3, -1, -2, -1, -2, -1, -2, -2,  2, -3, -4},  
21			{ -1, -3, -3, -3, -1, -3, -3, -4, -3,  4,  2, -3,  1,  0, -3, -2, -1, -3, -1,  3, -4},  
22			{ -1, -2, -3, -4, -1, -2, -3, -4, -3,  2,  4, -2,  2,  0, -3, -2, -1, -2, -1,  1, -4},  
23			{ -1,  2,  0, -1, -3,  1,  1, -2, -1, -3, -2,  5, -1, -3, -1,  0, -1, -3, -2, -2, -4},  
24			{ -1, -1, -2, -3, -1,  0, -2, -3, -2,  1,  2, -1,  5,  0, -2, -1, -1, -1, -1,  1, -4},  
25			{ -2, -3, -3, -3, -2, -3, -3, -3, -1,  0,  0, -3,  0,  6, -4, -2, -2,  1,  3, -1, -4},  
26			{ -1, -2, -2, -1, -3, -1, -1, -2, -2, -3, -3, -1, -2, -4,  7, -1, -1, -4, -3, -2, -4},  
27			{  1, -1,  1,  0, -1,  0,  0,  0, -1, -2, -2,  0, -1, -2, -1,  4,  1, -3, -2, -2, -4},  
28			{  0, -1,  0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, -1, -1, -1, -2, -1,  1,  5, -2, -2,  0, -4},  
29			{ -3, -3, -4, -4, -2, -2, -3, -2, -2, -3, -2, -3, -1,  1, -4, -3, -2, 11,  2, -3, -4},  
30			{ -2, -2, -2, -3, -2, -1, -2, -3,  2, -1, -1, -2, -1,  3, -3, -2, -2,  2,  7, -1, -4},  
31			{  0, -3, -3, -3, -1, -2, -2, -3, -3,  3,  1, -2,  1, -1, -2, -2,  0, -3, -1,  4, -4},  
32			{ -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4,  1},  
33		};
34
35		System.out.println("This program will score protein sequences.");
36		do {
37			System.out.print("Please enter a protein sequence. \nIf you finish entering, please type -1.\n>");
38			// 入力データ取得
39			input = sc.nextLine();
40			
41			// -1なら抜ける
42			if(input.equals("-1") != false) {
43				break;
44			}
45			
46			// 入力データをリストに追加していく(大文字化もする)
47			list.add(input.toUpperCase());
48
49		} while(true);
50		
51		// 2個以上のときはわからん
52		if(list.size() != 2) {
53			return;
54		}
55		
56		// リストから1行目のデータと2行目のデータを取る
57		String _oneStr = list.get(0);
58		String _twoStr = list.get(1);
59		
60		// 2行目のは1行目と文字数が小さいか同じしかありえない(仕様がわからん)
61		if(_oneStr.length() > _twoStr.length()) {
62			_twoStr = "*" + _twoStr;
63			while(_oneStr.length() > _twoStr.length()) {
64				_twoStr += "*";
65			}
66		}
67		
68		// 文字数は一致してるので後は出すだけ
69		System.out.println(_oneStr);
70		System.out.println(_twoStr);
71		int _sum = 0;
72		String _chartStr = "";
73		for(int i = 0; i < _oneStr.length(); i++) {
74			int _wk = protein[alp.indexOf(_oneStr.charAt(i))][alp.indexOf(_twoStr.charAt(i))];
75			_sum += _wk;
76			_chartStr = _chartStr + _wk + " ";
77		}
78		System.out.println(_chartStr + _sum);
79	}
80}

投稿2017/11/14 17:28

rururu3

総合スコア5545

Momomo.

2017/11/15 06:40

先生が課題に関して質問に答えてくれないということは本当です。信じてくださりありがとうございます。また、コードを教えてくださり感謝いたします。インプットを空のStringに設定するところなど、自分が思いつかなかったことなので大変参考になりました。教えていただいたコードを参考に間違えていたところを直し、知らなかったところは学ぼうと思います。本当にありがとうございました。助かりました。

行動規範の内容に同意します