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pythonでサーバ上のパスを用いてCSVファイル読み込み

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bkts94441

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目的

サーバ上に存在するCSVファイルの読み込みを行い、グラフを描画したい。

問題点

サーバ上のパスを読み込んでグラフを描画した後に保存するプログラムを書いたのですが、真っ白の画像が描画されてしまい、何も映っていない状態で保存されてしまいます。解決方法をネットで調べてみましたが、画像が読み込み出来ていないのか、保存方法が悪いのかわからずに困っています。そこでご教授をしていただきたいと思い、質問させて頂きました。よろしくお願い致します。

ソースコード

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import pandas as pd
import os
import glob
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
from scipy import genfromtxt
from datetime import datetime
from pathlib import Path
import sys

#アドレス参照(*は各実験日を示す)
files = glob.glob("/Server/share/main/Experiment/No1/*/Data/target.csv")

#グラフ設定
def graph():
    plt.rcParams["font.size"] = 13  
    plt.rcParams["xtick.labelsize"] = 12
    plt.rcParams["ytick.labelsize"] = 13
    plt.rcParams["legend.fontsize"] = 12 

#グラフラベル
def graphlabel():
    plt.xlabel("row")
    plt.ylabel("col")

########################################
################関数A###################
########################################
def A():
    #グラフ描画の定義
    fig = plt.figure(figsize=(20,30))
    #特定ファイルを特定パス内に存在する数だけグラフに描画
    for i, file in enumerate(files,1):
        graph()
        df = pd.read_csv(file) #csvファイルをデータフレーム型で読み込み
        ax = fig.add_subplot(len(files), 1, i) 
        df.plot(x='row', y='col', color='red',ax=ax,grid=True)
        ax.set_title(file.split(os.sep)[-3]) 
        graphlabel()
        plt.tight_layout()
    plt.savefig("/Users/user/Desktop/hoge.jpg")
##########################################   

使用環境

python3.5.2
Jupyter notebook
Windows 7

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回答 2

+1

コメント欄でのやりとりで回答を書いてしまったので情報共有のため回答欄の方にもに記しておきます。

パスが間違っていないはずであるのに、出力しようとすると
["File b'/Server/share/main/Experiment/No1/*/Data/target.csv""]
とエラーが出力されてしまいます。
何か別のモジュールを使用するのでしょうか。

上記質問者様の質問に対してpathlibを利用してサーバ以下の配下のファイルパスを取得できますよという回答です。

pathlibはWindowsPathも取り扱えるので以下のようなパス構造の場合

serverAはサーバ名です
serverA -
             |- test1.txt
             |- test2.txt

このようにしてserverA以下のファイルパスを取得できる。

from pathlib import Path

# ¥¥serverAはWindowsネットワークに対応したパス
# ログインが必要の場合ログインしたあと下記プログラム実行推奨
list(Path(r'¥¥serverA').glob("*"))
"""
[WindowsPath("¥¥serverA¥test1.txt"), WindowsPath("¥¥serverA¥test2.txt")]
"""


ちゃんとWindowsパスとして認識してくれます。

pathlib — オブジェクト指向のファイルシステムパス
teratail - Pythonでの社内共有サーバへのアクセス

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filesをprintしてみると何が表示されますか?
ファイルパスが正しく取得出来ていないのかなと疑っています。
またpd.read_csvの結果は正しく取得出来ているかdfの結果をprintしてみてください。

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  • 2017/11/13 11:13

    ご回答ありがとうございます。wakameさんの仰っていた通りに、ファイルパスが正しく取得出来ていない様でした。パスが間違っていないはずであるのに、出力しようとすると
    ["File b'/Server/share/main/Experiment/No1/*/Data/target.csv""]
    とエラーが出力されてしまいます。
    何か別のモジュールを使用するのでしょうか。

    キャンセル

  • 2017/11/13 11:52

    windows環境であることとpathlibをインポートされている点から以下のリンクが参考になると思います。
    https://teratail.com/questions/31088

    キャンセル

  • 2017/11/13 17:13

    ご回答ありがとうございました。問題を解決することが出来ました。また不明点がありましたら質問させて頂きますのでよろしくお願い致します。

    キャンセル

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