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  RDSに接続しようとしているのに、同サーバー内にあるMySQLのソケットファイルを参照しようとしているのが原因でしょう。これはアプリと同じサーバーから参照可能なソケットファイルを通じてMySQLに接続したいときに必要な設定であって、別インスタンス上にあるRDSに接続したいのならこの設定は要りません。

  database.ymlでRDSのエンドポイントを正しく設定してください。