回答編集履歴
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問題はPECLの構造によるもので、php.iniに書かれている記述を無視（php -n)してphpを実行するためにコンパイルの時点でxmlモジュールを読み込む設定にしていないとxmlを読み込まず、エラーとなってしまうことがあるとのことです。
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peclのスクリプトをいじるという手もありますが、php-xmlをインストールするのが普遍的で簡単な対応方法となっています。（peclがインストールされる度に同じことをしないといけないため）
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peclのスクリプトをいじるという手もありますが、php-xmlをインストールするのが普遍的で簡単な対応方法となっています。（peclがインストールされる度に同じことをしないといけないため）
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vi `which pecl`
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を実行するとpeclコマンドの内容を確認できるそうです。
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そしたら、 その最後の行に
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exec $PHP -C -n -q $INCARG -d date.timezone=UTC -d output_buffering=1 -d variables_order=EGPCS -d safe_mode=0 -d register_argc_argv="On" $INCDIR/peclcmd.php "$@"
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とあるので、`$PHP -C`の後にある`-n`を取ってやればいいとのことでした。
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peclの問題のようです。xmlを読み込むモジュールが無い場合などに発生するようです。
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http://serverfault.com/questions/589877/pecl-command-produces-long-list-of-errors
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http://serverfault.com/questions/589877/pecl-command-produces-long-list-of-errors
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問題はPECLの構造によるもので、php.iniに書かれている記述を無視（php -n)してphpを実行するためにコンパイルの時点でxmlモジュールを読み込む設定にしていないとxmlを読み込まず、エラーとなってしまうことがあるとのことです。
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peclのスクリプトをいじるという手もありますが、php-xmlをインストールするのが普遍的で簡単な対応方法となっています。（peclがインストールされる度に同じことをしないといけないため）
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