回答編集履歴
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es2015を使っている場合の解決方法に変更しました。
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呼び出し方が違うのでは？
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ちょっと時間がたってしまいましたが、このたび、私も browserify, babelify を使ってみることになって、この質問を思い出しました。
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まず、 .babelrc で es2015 を preset されてませんか？
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```javascript
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{presets: ["es2015"]}
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```
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を
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私の環境では、これを入れないと browseify 時点で以下のエラーになってしまいました。
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```
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export default function my_func() {
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^
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ParseError: 'import' and 'export' may appear only with 'sourceType: module'
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```
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で、[es2015のサイト](https://babeljs.io/docs/learn-es2015/)をみると、moduleの呼び方が変わっていて、require ではなく import を使うのではないでしょうか？で、es2015 の export と普通の requireを混ぜて使えるかはわからなかったので、server.js 側も修正して
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server.js
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```JavaScript
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import aaaaa from "./src/aaaaa.js";
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aaaaa();
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```
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ビルド&実行
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```
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$ browserify -v -t babelify server.js src/aaaaa.js -o bundle.js
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$ node bundle.js
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my_func is called
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```
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で動作しました。
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ググッて新しいのを見つけたので再挑戦です。
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呼び出し方が違うのでは？
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```javascript
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aaaaa.
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aaaaa.default();
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を試してもらえますか？
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参考：[Can't require() default export value in Babel 6.x](http://stackoverflow.com/questions/33704714/cant-require-default-export-value-in-babel-6-x)
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セミコロン抜けてた
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呼び出し方が違うのでは？
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```javascript
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aaaaa.my_func()
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aaaaa.my_func();
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```
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だと思いますが。
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