回答編集履歴
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### 追記の追記
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1点気づいた事があるので報告します。phar:// ストリームラッパーから
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アーカイブ内のファイルを利用する場合、どうもアーカイブに拡張子.pharがないと
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それをpharアーカイブであると判断できないようです。
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```php
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// /var/www/html/hoge/にphpmd.pharとphpmdのふたつを配置（中身はまったく同じ）
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// 拡張子.pharあり。問題なし
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include "phar://phpmd.phar/vendor/autoload.php";
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include "phar:///var/www/html/hoge/phpmd.phar/vendor/autoload.php";
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// 拡張子.pharなし。failed to open stream: phar error: invalid url or non-existent phar
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include "phar://phpmd/vendor/autoload.php";
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include "phar:///var/www/html/hoge/phpmd/vendor/autoload.php";
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```
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Vagrant + CentOS6.7 + PHP7、Windows7 + PHP5.6の2環境で試しましたが結果は同じでした。
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Phingを通しても実行してみました。
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PHPMDタスクのpharLocationにphpmd.pharを指定した場合は無事に処理が完了、
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pharLocationがphpmdの時はsiroronさんが提示されているものと同じエラーが発生しました。
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改めてPhingのクラスを確認したところ、PHPMDTaskにはphar:// ストリームラッパーを通して
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アーカイブ内のファイルを参照する処理があり、PHPUnitTaskにはありませんでした。
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PHPUnitTask
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[https://github.com/phingofficial/phing/blob/master/classes/phing/tasks/ext/phpunit/PHPUnitTask.php](https://github.com/phingofficial/phing/blob/master/classes/phing/tasks/ext/phpunit/PHPUnitTask.php)
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PHPMDTask
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[https://github.com/phingofficial/phing/blob/master/classes/phing/tasks/ext/phpmd/PHPMDTask.php#L233](https://github.com/phingofficial/phing/blob/master/classes/phing/tasks/ext/phpmd/PHPMDTask.php#L233)
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### 追記
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**以下の内容は間違えています。pharファイルへのアクセスを絶対パスで記述する場合
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`phar:///`とスラッシュ3つで問題ありません。失礼しました。**
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間違いの訂正2
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### 追記
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以下の内容は間違えています。pharファイルへのアクセスを絶対パスで記述する場合
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**以下の内容は間違えています。pharファイルへのアクセスを絶対パスで記述する場合
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`phar:///`とスラッシュ3つで問題ありません。失礼しました。
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`phar:///`とスラッシュ3つで問題ありません。失礼しました。**
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間違いの訂正
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### 追記
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以下の内容は間違えています。pharファイルへのアクセスを絶対パスで記述する場合
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`phar:///`とスラッシュ3つで問題ありません。失礼しました。
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> [PHP Error] include_once(phar:///usr/local/bin/phpmd/vendor/autoload.php): failed to open stream: phar error: invalid url or non-existent phar "phar:///usr/local/bin/phpmd/vendor/autoload.php" [line 233 of phar:///usr/local/bin/phing/classes/phing/tasks/ext/phpmd/PHPMDTask.php]
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このあたりのログからするとphpmd.pharアーカイブ内のautoload.phpのインクルードに
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