回答編集履歴
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質問が変わったので書き直し
test
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「ユニークキーが衝突した場合には`UPDATE`したい」ということでしたら、`ON DUPLICATE KEY UPDATE`という、そのままな名前の構文があります([リファレンス](https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/ja/insert-on-duplicate.html))。
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そうでないような、別なテーブルを引く条件の場合はトランザクションに入るほかないかもしれません(どちらにしろ、条件次第です)。
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